Fibrinogen och fibrin spelar viktiga roller i koagelbildning, fibrinolys, cellulära och matrisinteraktioner, inflammation och sårläkning. Dessa biologiska händelser regleras i stor utsträckning genom koagelbildning och genom kompletterande interaktioner mellan specifika reaktiva ställen på fibrin (ogen) och extrinsiska molekyler såsom enzymer, proteiner inklusive andra koagulationsfaktorer eller cellreceptorer., Fibrinogen består av två uppsättningar av tre polypeptidkedjor kallade Aa, Bß och γ, varav alla sex är förenade med disulfidbroar för att bilda den amino-terminala e-domänen. Molekylerna är långsträckta trinodulära strukturer som består av två globulära yttre d-domäner som är anslutna till sin centrala e-domän med ett spiralspole-segment. Dessa områden innehåller konstitutiva bindande platser (t. ex., Da, Db, yXL, d: d, γ’, trombinsubstrat, trombocytreceptor, leukocytintegrinreceptor) samt interaktiva platser som uttrycks som ett resultat av fibrinogenspjälkning genom trombin eller som exponeras som en följd av polymerisering (t.ex. t-PA-bindningsställen). Andra relevanta konstitutiva ställen i fibrinogen inkluderar två ställen för erkännande av trombinsubstrat i varje e-domän plus ett icke-substratbindningsställe med hög affinitet i varje γ-kedja som också binder faktor XIII., Konstitutiva bindningsställen på fibrinogen deltar i fibrin-montering genom självförening (yXL eller D:D) eller genom komplementär association med exponerade fibrin-platser (Da till EA och Db till E B). Andra relevanta konstitutiva ställen i fibrin inkluderar ett trombinbinbinbindningsställe med låg affinitet i fibrin e-domänen som uppenbarligen förblir som en rest av substratbindningsstället.
Fibrin polymerisation initieras av trombin klyvning av fibrinopeptide EN (FPA) från fibrinogen Aa kedjor, exponera två E domän E platser., Klyvning av fibrinopeptid B (FPB) från Bß-kedjor exponerar ett annat e-domänpolymeriseringsställe, E B, som också interagerar med blodplättar, fibroblaster och endotelceller. Fibrin generation följs av end-to-middle intermolekylära d-To-e föreningar som bildar linjära och liksidigt grenade dubbelsträngade fibriller, och åtföljs av laterala fibril föreningar som bildar flera strandade fibrer., Samtidigt introducerar trombinaktiverad faktor XIIIa kovalenta tvärlänkar i dessa polymerer, huvudsakligen mellan γ-kedjor (vid YXL-ställen som bildar γ-dimer) och α-kedjor (α-polymerer), för att slutföra den mogna koaguleringsnätverksstrukturen.