Les fondateurs Freddy Bensch et Kevin McNerney étaient colocataires à L’Université du Colorado à Boulder, où ils travaillaient également à temps partiel dans le nettoyage de fûts dans une brasserie locale. Après avoir obtenu son diplôme en 1993, Bensch a déménagé en Californie pour étudier à L’American Brewers Guild, tandis que McNerney a continué à travailler dans plusieurs brasseries du Colorado et de la Californie, y compris Rockies Brewing Company, Avery Brewing Company et Mammoth Brewing Company. Bensch a visité Atlanta pendant les Jeux Olympiques d’été de 1996 et a vu l’occasion d’apporter une brasserie de style West Coast au sud-est., McNerney a rapidement rejoint Bensch à Atlanta, recueillant des fonds initiaux pour ouvrir le premier emplacement de la brasserie au large de L’Interstate 20 sur Fulton Industrial Boulevard.
Bensch a nommé la brasserie après avoir fait du kayak sur Sweetwater Creek, un affluent de la rivière Chattahoochee, dans le Parc D’État de Sweetwater Creek en Géorgie, situé à quelques kilomètres à l’ouest de la brasserie. La brasserie a également adopté la devise officielle « Don’t Float the Mainstream » en hommage à son homonyme. Bensch et McNerny ont commencé à brasser en janvier 1997 et ont vendu leur premier fût le 17 février 1997 – SweetWater ESB et Blue., La bière la plus populaire de SweetWater, la SweetWater 420 Extra Pale Ale, nommée d’après la date à laquelle elle a été brassée pour la première fois (le 20 avril), a rapidement suivi.
Deux ans plus tard, SweetWater a accueilli la World Beer Cup, une compétition internationale de brassage. En 2002, SweetWater a remporté le prix de la petite brasserie de l’année au Great American Beer Festival de Denver. En 2003, la brasserie a dépassé son espace sur Fulton Industrial Boulevard et a déménagé dans une installation de 25 000 pieds carrés dans le Parc Industriel Armour Circle D’Atlanta sur Ottley Drive., En 2004, SweetWater a signé avec United Distributors, l’un des distributeurs de boissons les plus importants aux États-Unis, faisant passer la distribution de SweetWater de 200 000 à 700 000 caisses en six ans. Kevin McNerney a démissionné de SweetWater Brewing Company en 2008 pour passer plus de temps avec sa famille, et est devenu plus tard maître brasseur à 5 Season’s Brewing Company. En 2012, SweetWater a terminé un projet d’expansion en trois phases, ajoutant des bureaux et des espaces événementiels supplémentaires, une ligne d’embouteillage et une salle d’emballage, ainsi qu’un parc de réservoirs qui ont augmenté la capacité de 100 000 à 500 000 barils par an.,
en 2013, SweetWater s’est classée 26e parmi les 50 meilleures brasseries américaines et 19e parmi les 50 meilleures brasseries artisanales américaines en fonction du volume des ventes.
Le 29 septembre 2014, SweetWater a annoncé qu’elle vendait une participation minoritaire à TSG Consumer Partners.
en juillet 2015, SweetWater a promu Kim Jones de Directeur Financier à Directeur Général. Elle était directrice financière depuis 2013 et avant cela, elle a occupé des postes de direction financière et de gestion chez Spanx Inc. et La Compagnie Coca-Cola.