Fondatori Freddy Bensch e Kevin McNerney erano compagni di stanza presso l’Università del Colorado a Boulder, dove hanno anche lavorato part-time fusti di pulizia in un birrificio locale. Dopo la laurea nel 1993, Bensch si trasferì in California per studiare alla American Brewers Guild, mentre McNerney ha continuato a lavorare in diversi birrifici in Colorado e California, tra cui Rockies Brewing Company, Avery Brewing Company e Mammoth Brewing Company. Bensch visitò Atlanta durante le Olimpiadi estive del 1996 e vide l’opportunità di portare un birrificio in stile West Coast a sud-est., McNerney si unì presto a Bensch ad Atlanta raccogliendo fondi iniziali per aprire la prima sede del birrificio fuori dalla Interstate 20 su Fulton Industrial Boulevard.
Bensch chiamato il birrificio dopo kayak lungo Sweetwater Creek, un affluente del fiume Chattahoochee, in Georgia Sweetwater Creek State Park situato a poche miglia a ovest del birrificio. Il birrificio ha anche adottato il motto ufficiale “Don’t Float the Mainstream” come tributo al suo omonimo. Bensch e McNerny iniziarono a produrre birra nel gennaio 1997 e vendettero il loro primo barile il 17 febbraio 1997 – SweetWater ESB e Blue., La birra più popolare di SweetWater, SweetWater 420 Extra Pale Ale, prende il nome dalla data in cui è stata prodotta per la prima volta (20 aprile), presto seguita.
Due anni dopo, SweetWater ha ospitato la World Beer Cup, una competizione internazionale di birra. Nel 2002 SweetWater ha vinto la Piccola birreria dell’anno al Great American Beer Festival di Denver. Nel 2003 il birrificio ha superato il suo spazio su Fulton Industrial Boulevard e si è trasferito in una struttura di 25.000 piedi quadrati nel parco industriale Armour Circle di Atlanta su Ottley Drive., Nel 2004 SweetWater ha firmato con United Distributors, uno dei maggiori distributori di bevande negli Stati Uniti, aumentando la distribuzione di SweetWater da 200.000 a 700.000 casi in sei anni. Kevin McNerney si è dimesso dalla SweetWater Brewing Company nel 2008 per trascorrere più tempo con la sua famiglia, e in seguito è diventato brewmaster presso la 5 Season’s Brewing Company. Nel 2012 SweetWater ha completato un progetto di espansione in tre fasi aggiungendo ulteriori uffici e spazi per eventi, una linea di imbottigliamento e una sala di confezionamento e una fattoria di serbatoi che ha aumentato la capacità da 100.000 a 500.000 barili all’anno.,
Nel 2013 SweetWater si è classificata al 26 ° posto tra le prime 50 birrerie statunitensi e al 19 ° tra le prime 50 aziende produttrici di birra artigianali statunitensi in base al volume delle vendite.
Il 29 settembre 2014, SweetWater ha annunciato che stava vendendo una quota di minoranza a TSG Consumer Partners.
Nel luglio 2015, SweetWater ha promosso Kim Jones da Chief Financial Officer a Chief Executive Officer. È stata CFO dal 2013 e in precedenza ha ricoperto posizioni di senior financial and management presso Spanx Inc. e la Coca-Cola Company.