Gründer Freddy Bensch und Kevin McNerney waren Mitbewohner an der University of Colorado in Boulder, wo sie auch Teilzeit Reinigung Fässer in einer lokalen Brauerei gearbeitet. Nach seinem Abschluss in 1993 zog Bensch nach Kalifornien, um bei der American Brewers Guild zu studieren, während McNerney in mehreren Brauereien in Colorado und Kalifornien arbeitete, darunter Rockies Brewing Company, Avery Brewing Company und Mammoth Brewing Company. Bensch besuchte Atlanta während der Olympischen Sommerspiele 1996 und sah eine Gelegenheit, eine Brauerei im Westküstenstil nach Südosten zu bringen., McNerney schloss sich bald Bensch in Atlanta an und sammelte erste Mittel, um den ersten Standort der Brauerei an der Interstate 20 am Fulton Industrial Boulevard zu eröffnen.
Bensch benannte die Brauerei nach dem Kajakfahren am Sweetwater Creek, einem Nebenfluss des Chattahoochee River, im georgianischen Sweetwater Creek State Park, der sich einige Meilen westlich der Brauerei befindet. Die Brauerei nahm auch das offizielle motto „Don‘ T Float Mainstream“ als eine Hommage an seinen Namensvetter. Bensch und McNerny begannen im Januar 1997 mit dem Brauen und verkauften ihr erstes Fass am Februar 17, 1997 – SweetWater ESB und Blue., Sweetwaters beliebtestes Bier, SweetWater 420 Extra Pale Ale, benannt nach dem Datum, an dem es zum ersten Mal gebraut wurde (20.
Zwei Jahre später veranstaltete SweetWater den World Beer Cup, einen internationalen Brauwettbewerb. 2002 gewann SweetWater die Small Brewery of the Year beim Great American Beer Festival in Denver. Im Jahr 2003 zog die Brauerei ihre Fläche am Fulton Industrial Boulevard aus und zog in eine 25.000 Quadratmeter große Anlage im Armour Circle Industrial Park in Atlanta am Ottley Drive., Im Jahr 2004 unterschrieb SweetWater bei United Distributors, einem der größten Getränkehändler in den USA, und erhöhte den Vertrieb von SweetWater in sechs Jahren von 200.000 auf 700.000 Fälle. Kevin McNerney trat 2008 von der SweetWater Brewing Company zurück, um mehr Zeit mit seiner Familie zu verbringen, und wurde später Braumeister bei 5 Season ‚ s Brewing Company. 2012 schloss SweetWater ein dreiphasiges Erweiterungsprojekt mit zusätzlichen Büro-und Veranstaltungsflächen, einer Abfüll-und Verpackungshalle sowie einer Tankfarm ab, die die Kapazität von 100.000 auf 500.000 Barrel pro Jahr erhöhte.,
Im Jahr 2013 belegte SweetWater den 26. Platz unter den Top 50 US-Brauereien und den 19. Platz unter den Top 50 US-Handwerksbrauereien, basierend auf dem Verkaufsvolumen.
Am 29. September 2014 gab SweetWater bekannt, dass es eine Minderheitsbeteiligung an TSG Consumer Partners verkauft.
Im Juli 2015 beförderte SweetWater Kim Jones vom Chief Financial Officer zum Chief Executive Officer. Sie war seit 2013 CFO und davor leitete sie Finanz-und Managementpositionen bei Spanx Inc. und Die Coca-Cola Company.