speciatie kan op twee algemene manieren plaatsvinden. Een enkele soort kan in de loop van de tijd veranderen in een nieuwe vorm die genoeg anders is om als een nieuwe soort te worden beschouwd. Dit proces staat bekend als anagenese. Meer algemeen, een soort kan worden gesplitst in twee groepen die niet langer dezelfde genenpool delen. Dit proces staat bekend als cladogenese. Er zijn verscheidene manieren waarin anagenesis en cladogenesis kunnen plaatsvinden. In alle gevallen treedt reproductieve isolatie op.,
Sympatrische speciatie
Sympatrische speciatie treedt op wanneer populaties van een soort die dezelfde habitat delen reproductief van elkaar geïsoleerd raken. Dit speciatiefenomeen komt het meest voor door middel van polyploïdie, waarbij een nageslacht of groep nakomelingen zal worden geproduceerd met twee keer het normale aantal chromosomen. Wanneer een normaal individu twee kopieën van elk chromosoom (diploïdie) heeft, kunnen deze nakomelingen vier kopieën (tetraploïdie) hebben. Een tetraploïde individu kan niet paren met een diploïde individu, waardoor reproductieve isolatie ontstaat.,
Sympatrische speciatie is zeldzaam. Het komt vaker voor bij planten dan bij dieren, omdat het zoveel gemakkelijker is voor planten om zichzelf te bevruchten dan voor dieren. Een tetraploïdie plant kan zichzelf bevruchten en nakomelingen creëren. Om zich te kunnen voortplanten moet een tetraploïdie een ander dier van dezelfde soort vinden, maar van ander geslacht, dat ook willekeurig polyploïdie heeft ondergaan.
Allopatric speciatie
Allopatric speciatie, de meest voorkomende vorm van speciatie, komt voor wanneer populaties van een soort geografisch geïsoleerd raken., Wanneer populaties worden gescheiden, genstroom tussen hen stopt. Na verloop van tijd kunnen de populaties genetisch verschillend worden in reactie op de natuurlijke selectie die door hun verschillende omgevingen wordt opgelegd. Als de populaties relatief klein zijn, kunnen ze een stichtereffect ervaren: de populaties kunnen verschillende allelische frequenties bevatten toen ze werden gescheiden. Selectie en genetische drift zal anders werken op deze twee verschillende genetische achtergronden, het creëren van genetische verschillen tussen de twee nieuwe soorten.,
Parapatric speciatie
Parapatric speciatie is uiterst zeldzaam. Het komt voor wanneer populaties niet worden gescheiden door een geografische barrière, zoals een waterlichaam, maar door een extreme verandering in habitat. Hoewel populaties in deze gebieden onderling kunnen broeden, ontwikkelen zij vaak verschillende kenmerken en levensstijlen. Reproductieve isolatie is in deze gevallen niet geografisch, maar eerder temporeel of gedragsmatig. Bijvoorbeeld, planten die leven op grenzen tussen zeer verschillende klimaten kunnen bloeien op verschillende tijdstippen als reactie op hun verschillende omgevingen, waardoor ze niet in staat om te kruisen.,