als een kind wordt gediagnosticeerd en behandeld binnen de eerste paar levensmaanden voordat het kind een ernstige infectie heeft, dan is de langetermijnoverleving meer dan 90%. Met vroege behandeling zouden de meeste kinderen met SCID hun eigen werkend immuunsysteem moeten kunnen ontwikkelen. De beste behandeling voor een kind met SCID hangt af van verschillende factoren, waaronder het type SCID, de gezondheid van het kind en aanbevelingen van de arts.,
De meeste zuigelingen met SCID worden behandeld met HSCT, of beenmergtransplantatie, wat resulteert in een nieuw immuunsysteem dat in staat is infecties te bestrijden. Bij HSCT nemen artsen gezonde bloedvormende cellen die zich kunnen ontwikkelen tot een gezond immuunsysteem van een donor en zetten ze in een kind. De donorcellen voorzien het kind van een immuunsysteem.
een andere minder vaak voorkomende maar veelbelovende behandelingsoptie is gentherapie, die momenteel in klinische studies wordt uitgevoerd. In gentherapie halen artsen de defecte bloedvormende cellen van een kind uit, corrigeren ze het defect en zetten ze de gecorrigeerde cellen terug in het kind., De gerepareerde cellen voorzien het kind van een werkend immuunsysteem.
een derde behandeling, enzymvervangingstherapie, kan alleen worden gebruikt voor kinderen met ADA-SCID. Bij enzymvervangingstherapie wordt het ontbrekende enzym regelmatig bij het kind met SCID geïnjecteerd om het ada-enzym te versterken. De resultaten zijn tijdelijk en herstellen het immuunsysteem niet permanent. Uiteindelijk zullen kinderen met ADA-SCID HSCT of gentherapie nodig hebben voor langetermijnresultaten.,
voorafgaand aan deze behandelingen zal een kind met SCID het behandelingsproces starten door antibiotica, antivirale middelen en antischimmelmiddelen te gebruiken om infecties af te weren. Het kind zal ook immunoglobuline therapie, of Ig, een infusie van antilichamen ontworpen om het immuunsysteem van het kind te stimuleren ontvangen. De Ig wordt verkregen door menselijke plasmadonors.