Madame Lelica

le virus MERS-CoV est membre du groupe bêta des coronavirus, Betacoronavirus, lignée C. les génomes MERS-CoV sont classés phylogénétiquement en deux clades, clade A et B. Les premiers cas de MERS étaient des clades A (EMC/2012 et Jordan-N3/2012), et les nouveaux cas sont génétiquement distincts (clade B).

MERS-CoV est l’un des sept coronavirus connus pour infecter les personnes, y compris hcov-229e,HCoV-NL63,HCoV-OC43,HCoV-HKU1, les originaux de sars-CoV (ou SARS-CoV-1) et SARS-CoV-2., Le MERS-CoV est distinct du coronavirus du SRAS et distinct du coronavirus du rhume et des bétacoronavirus humains endémiques connus HCoV-OC43 et HCoV-HKU1. Jusqu’au 23 mai 2013, le MERS-CoV avait souvent été appelé virus de type SRAS, ou simplement le nouveau coronavirus, et auparavant, il était appelé familièrement sur les tableaux de messages comme le « SRAS Saoudien ».

en novembre 2019, 2 494 cas de MERS ont été signalés avec 858 décès, de sorte que le taux de létalité des cas est> 30%. 182 génomes ont été séquencés en 2015 (94 chez l’homme et 88 chez le dromadaire)., Toutes les séquences sont>similaires à 99%. Les génomes peuvent être divisés en deux clades-A et B – la majorité des cas étant causés par le clade B. Les souches humaines et les souches de chameaux sont entremêlées, ce qui suggère de multiples événements de transmission.

OriginEdit

Le premier cas confirmé a été signalé à Djeddah, en Arabie Saoudite en avril 2012. Le virologue égyptien Ali Mohamed Zaki a isolé et identifié un coronavirus jusque-là inconnu des poumons de l’homme. Zaki a ensuite publié ses conclusions le 24 septembre 2012 sur ProMED-mail., Les cellules isolées ont montré des effets cytopathiques (CPE), sous forme d’arrondi et de formation de syncytia.

un deuxième cas a été découvert en septembre 2012, un homme de 49 ans vivant au Qatar présentait des symptômes grippaux similaires, et une séquence du virus était presque identique à celle du premier cas. En novembre 2012, des cas similaires sont apparus au Qatar et en Arabie Saoudite. D’autres cas ont été notés, avec des décès associés, et la recherche et la surveillance rapides de ce nouveau coronavirus ont commencé.,Il n’est pas certain que les infections soient le résultat d’un seul événement zoonotique avec transmission interhumaine subséquente, ou si les multiples sites géographiques d’infection représentent plusieurs événements zoonotiques provenant d’une source commune inconnue.

Une étude menée par Ziad Memish de L’Université de Riyad et ses collègues suggère que le virus est apparu entre juillet 2007 et juin 2012, avec peut-être jusqu’à 7 transmissions zoonotiques distinctes., Parmi les réservoirs animaux, le CoV a une grande diversité génétique mais les échantillons de patients ont suggéré un génome similaire, et donc une source commune, bien que les données soient limitées. Il a été déterminé par l’analyse de l’horloge moléculaire que les virus de L’EMC/2012 et de L’Angleterre/Qatar / 2012 datent du début de 2011, suggérant que ces cas descendaient d’un seul événement zoonotique. Il semble que le MERS-CoV circule dans la population humaine depuis plus d’un an sans détection et suggère une transmission indépendante d’une source inconnue.,

TropismEdit

chez l’homme, le virus présente un fort tropisme pour les cellules épithéliales bronchiques non affiliées, et il a été démontré qu’il échappe efficacement aux réponses immunitaires innées et antagoniser la production d’interféron (IFN) dans ces cellules. Ce tropisme est unique en ce sens que la plupart des virus respiratoires ciblent les cellules ciliées.,

en raison de la similitude clinique entre le MERS-CoV et le SARS-CoV, il a été proposé qu’ils puissent utiliser le même récepteur cellulaire; l’exopeptidase, l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2). Cependant, il a été découvert plus tard que la neutralisation de L’ACE2 par des anticorps recombinants n’empêche pas l’infection par le MERS-CoV. D’autres recherches ont identifié la dipeptidyl peptidase 4 (DPP4; également connue sous le nom de CD26) comme récepteur cellulaire fonctionnel du MERS-CoV. Contrairement à d’autres récepteurs de coronavirus connus, l’activité enzymatique de DPP4 n’est pas requise pour l’infection., Comme on pouvait s’y attendre, la séquence d’acides aminés de DPP4 est fortement conservée d’une espèce à l’autre et est exprimée dans l’épithélium bronchique et les reins humains. Les gènes DPP4 des chauves-souris semblent avoir été soumis à un degré élevé d’évolution adaptative en réponse aux infections à coronavirus, de sorte que la lignée menant au MERS-CoV peut avoir circulé dans les populations de chauves-souris pendant une longue période avant d’être transmise aux personnes.

Transmissionmodifier

Le 13 février 2013, l’Organisation Mondiale de la santé a déclaré que « le risque de transmission durable de personne à personne semble être très faible., »Les cellules que le MERS-CoV infecte dans les poumons ne représentent que 20% des cellules épithéliales respiratoires, de sorte qu’un grand nombre de virions sont probablement nécessaires pour être inhalés pour provoquer une infection.

Le Dr Anthony S. Fauci des National Institutes of Health de Bethesda, dans le Maryland, a déclaré qu’à l’heure actuelle, le MERS-CoV « ne se propage pas du tout de manière durable d’une personne à l’autre. »Le Dr Fauci a déclaré qu’il existe un danger potentiel dans la mesure où il est possible que le virus mute en une souche qui se transmet d’une personne à l’autre.,

cependant, l’infection des travailleurs de la santé (TS) a suscité des inquiétudes quant à la transmission interhumaine.

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) répertorient les MERS comme transmissibles d’humain à Humain. De leur FAQ, en réponse à la question « le MERS-CoV se propage – t-il d’une personne à l’autre? », ils répondent  » MERS-CoV a été montré pour se propager entre les personnes qui sont en contact étroit. La Transmission des patients infectés au personnel de santé a également été observée. Des groupes de cas dans plusieurs pays font l & apos; objet d & apos; enquêtes., »Il y a aussi un article du New York Times qui fournit un contexte corrélatif pour cela.

cependant, le 28 mai, le CDC a révélé que L’homme de L’Illinois qui était à l’origine pensé pour avoir été la première incidence de personne à personne propagation (de L’homme de L’Indiana lors d’une réunion d’affaires), avait en fait testé négatif pour MERS-CoV. Après avoir effectué des tests supplémentaires et plus définitifs à l’aide d’un dosage d’anticorps neutralisants, les experts du CDC ont conclu que le patient de L’Indiana n’avait pas propagé le virus au patient de L’Illinois., Les Tests ont conclu que L’homme de L’Illinois n’avait pas été infecté auparavant. Il est possible que le MERS silencieux se produise, c’est lorsque le patient ne développe pas de symptômes. Les premières recherches ont montré que jusqu’à 20% des cas ne montrent aucun signe d’infection active mais ont des anticorps MERS-CoV dans leur sang.

EvolutionEdit

Le virus semble avoir son origine dans les chauves-souris. Le virus a été isolé à partir d’une chauve-souris., Ce virus est étroitement lié au coronavirus de chauve-souris Tylonycteris hku4 et au coronavirus de chauve-souris Pipistrellus hku5. Les preuves sérologiques montrent que ces virus infectent les chameaux depuis au moins 20 ans. L’ancêtre commun le plus récent de plusieurs souches humaines a été daté de mars 2012 (intervalle de confiance à 95% de décembre 2011 à juin 2012).

Les données disponibles à ce jour suggèrent que les virus sont présents chez les chauves-souris depuis un certain temps et s’étaient propagés aux chameaux au milieu des années 1990. les virus semblent s’être propagés des chameaux aux humains au début des années 2010., L’espèce hôte originale de chauve-souris et le moment de l’infection initiale chez cette espèce n’ont pas encore été déterminés.

L’examen des séquences de 238 isolats a suggéré que ce virus a évolué en trois clades différents dans l’utilisation du codon, l’hôte et la distribution géographique.

réserve Naturelledit

Les premières recherches ont suggéré que le virus est lié à celui trouvé dans la chauve-souris tombe égyptienne. En septembre 2012, Ron Fouchier a émis l’hypothèse que le virus pourrait provenir de chauves-souris., Les travaux de L’épidémiologiste Ian Lipkin de L’Université Columbia à New York ont montré que le virus isolé d’une chauve-souris semblait correspondre au virus trouvé chez l’homme. Des bétacoronavirus 2c ont été détectés chez des chauves-souris Nycteris au Ghana et des chauves-souris Pipistrellus en Europe qui sont phylogénétiquement liées au virus MERS-CoV., Cependant, le principal réservoir naturel où les humains contractent l’infection virale est resté inconnu jusqu’au 9 août 2013, un rapport publié dans la revue The Lancet Infectious Diseases a montré que 50 sur 50 (100%) du sérum sanguin de chameaux omanais et 15 sur 105 (14%) de chameaux espagnols présentaient des anticorps spécifiques à la protéine MERS-CoV Spike. Le sérum sanguin de moutons, de chèvres, de bovins et d’autres camélidés européens n’avait pas de tels anticorps.

peu après, le 5 septembre 2013, Une étude séroépidémiologique publiée dans le journal of Eurosurveillance par R. A Perera et al., où ils ont étudié 1343 sérums humains et 625 animaux ont indiqué, la présence abondante d’anticorps spécifiques MERS-CoV dans 108 Des 110 chameaux dromadaires Égyptiens, mais pas chez d’autres animaux tels que les chèvres, les vaches ou les moutons dans cette région. Ce sont les premiers rapports scientifiques importants qui ont indiqué le rôle des « chameaux dromadaires » en tant que réservoir de MERS-CoV.

des travaux récents lient les chameaux au virus. Une dépêche anticipée pour la revue Emerging Infectious Diseases enregistre des recherches montrant l’infection à coronavirus chez les veaux de chameaux dromadaires et les adultes, 99.,9% correspondant aux génomes du clade humain B MERS-CoV.

Au moins une personne qui est tombée malade du MERS était connue pour être entrée en contact avec des chameaux ou avoir récemment bu du lait de chamelle.

des pays comme L’Arabie Saoudite et les Émirats Arabes Unis produisent et consomment de grandes quantités de viande de chameau. Il est possible que les chauves-souris africaines ou australiennes hébergent le virus et le transmettent aux chameaux. Des chameaux importés de ces régions pourraient avoir transporté le virus au Moyen-Orient.,

en 2013, le MERS-CoV a été identifié chez trois membres d’un troupeau de dromadaires détenus dans une grange du Qatar, ce qui a été lié à deux cas humains confirmés qui se sont rétablis depuis. La présence de MERS-CoV chez les chameaux a été confirmée par L’Institut National de la santé publique et de l’environnement (RIVM) du Ministère de la santé et le centre médical Erasmus (Centre collaborateur de L’OMS), aux Pays-Bas. Aucun des chameaux ne présentait de signe de maladie lors du prélèvement des échantillons., En novembre 2013, le Conseil suprême de la santé du Qatar a conseillé aux personnes souffrant de problèmes de santé sous-jacents, tels que les maladies cardiaques, le diabète, les maladies rénales, les maladies respiratoires, les personnes immunodéprimées et les personnes âgées, d’éviter tout contact étroit avec les animaux lors de la visite des fermes et des marchés, et de,

Une autre étude sur les dromadaires D’Arabie Saoudite publiée en décembre 2013 a révélé la présence de MERS-CoV chez 90% des dromadaires évalués (310), suggérant que les dromadaires pourraient non seulement être le principal réservoir de MERS-CoV, mais aussi la source animale de MERS.

selon la mise à jour du résumé du MERS-CoV du 27 mars 2014, des études récentes confirment que les chameaux sont la principale source du MERS-CoV infectant les humains, tandis que les chauves-souris pourraient être le réservoir ultime du virus., Les preuves comprennent la fréquence à laquelle le virus a été trouvé chez des chameaux auxquels des cas humains ont été exposés, les données sériologiques qui montrent une transmission généralisée chez les chameaux et la similitude du CoV de chameau avec le CoV humain.

Le 6 juin 2014, Le Journal Arab News a mis en évidence les derniers résultats de recherche dans le New England Journal of Medicine dans lequel un saoudien de 44 ans qui gardait un troupeau de neuf chameaux est mort du MERS en novembre 2013., Ses amis ont dit qu’ils l’ont vu appliquer un médicament topique sur le nez d’un de ses chameaux malades—quatre d’entre eux auraient été malades avec des écoulements nasaux—sept jours avant qu’il ne soit lui-même atteint du MERS. Les chercheurs ont séquencé le virus trouvé dans l’un des chameaux malades et le virus qui a tué l’homme, et ont constaté que leurs génomes étaient identiques. Dans ce même article, Arab News a rapporté qu’au 6 juin 2014, 689 cas de MERS avaient été signalés dans le Royaume D’Arabie Saoudite, avec 283 décès.,

Taxonomiedit

le MERS-CoV est plus étroitement apparenté aux coronavirus chauves-souris HKU4 et HKU5 (lignée 2C) qu’au SARS-CoV (lignée 2b) (2, 9), partageant plus de 90% de l’identité de séquence avec leurs relations les plus proches, les coronavirus chauves-souris HKU4 et HKU5 et donc considéré comme appartenant à la même espèce par le Comité international de taxonomie des virus (ICTV).,; virus à ARN simple brin à sens positif » commande: Nidovirales » famille: Coronaviridae » sous-famille: Coronavirinae » Type: Betacoronavirus » espèce: Betacoronavirus 1 (communément appelé coronavirus humain OC43), coronavirus humain hku1, coronavirus Murin, coronavirus de chauve-souris Pipistrellus hku5, coronavirus de chauve-souris Rousettus hku9, coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère, coronavirus de chauve-souris TYLONYCTERIS hku4, COV compétitif

• virus hôtes:
  • homo sapiens (humain)
  • chameaux
  • chauves-souris

souches:

• isolat:
• isolat:
• NCBI