alignement Global
Les outils D’alignement Global créent un alignement de bout en bout des séquences à aligner.
Needle (EMBOSS)
EMBOSS Needle crée un alignement global optimal de deux séquences à l’aide de L’algorithme Needleman-Wunsch.
Launch Needle
Brancard (EMBOSS)
EMBOSS Brancard utilise une modification de L’algorithme Needleman-Wunsch qui permet d’aligner globalement des séquences plus grandes.,
Launch Stretcher
alignement Local
outils d’alignement Local trouvez un ou plusieurs alignements décrivant la ou les régions les plus similaires dans les séquences à aligner. Ils peuvent aligner les séquences de protéines et de nucléotides.
Water (EMBOSS)
EMBOSS Water utilise L’algorithme de Smith-Waterman (modifié pour améliorer la vitesse) pour calculer l’alignement local de deux séquences.
Launch Water
Matcher (EMBOSS)
EMBOSS Matcher identifie les similitudes locales entre deux séquences à l’aide d’un algorithme rigoureux basé sur L’application LALIGN.,
Launch Matcher
LALIGN
LALIGN trouve des duplications internes en calculant des alignements locaux non intersecteurs de séquences de protéines ou D’ADN.
Lancement LALIGN