Global Alignment
Global alignment tools skapar en end-to-end-justering av sekvenserna som ska anpassas.
Needle (EMBOSS)
EMBOSS Needle skapar en optimal global anpassning av två sekvenser med hjälp av Needleman-Wunsch-algoritmen.
Starta nål
bår (relief)
relief bår använder en modifiering av Needleman-Wunsch algoritm som gör att större sekvenser kan vara globalt inriktade.,
Starta bår
lokal inriktning
lokala inriktningsverktyg hitta en eller flera anpassningar som beskriver de mest liknande regionerna inom de sekvenser som ska anpassas. De kan anpassa protein och nukleotidsekvenser.
vatten (relief)
relief vatten använder Smith-Waterman algoritm (modifierad för hastighetsförbättringar) för att beräkna den lokala inriktningen av två sekvenser.
Starta vatten
Matcher (relief)
PRÄGLINGSMATCHER identifierar lokala likheter mellan två sekvenser med hjälp av en rigorös algoritm baserad på lalign ansökan.,
Lanseringsmatcher
LALIGN
lalign hittar interna dupliceringar genom att beräkna icke-korsande lokala anpassningar av protein-eller DNA-sekvenser.
Starta LALIGN