Fuelwood och foderinsamling
Fuelwood och foderinsamling är två huvudsakliga orsaker till nedbrytning av livsmiljöer i östra Himalaya, vilket orsakar förändringar i livsmiljösammansättning och artförlust. Detta är särskilt allvarligt i lågländerna i Indien och Nepal där befolkningstrycket är störst.
markomställning
befolkningen i regionen expanderar och skogar och gräsmarker omvandlas till jordbruksmark och bosättningar., Som en följd av detta decimeras stora regioner av biologisk mångfald rika livsmiljöer och viktiga djurlivskorridorer. Detta är mest intensivt i de tätbefolkade regionerna i Nepal och de indiska staterna Sikkim och Assam.
Overgrazing
omfattande bete av tamdjur är en annan genomgripande källa till livsmiljö och biologisk mångfald förlust i hela östra Himalaya., De artrika höghöjda alpina ängarna, när de betas av domesticerade jak, domineras av några arter av obehagliga buskar; hotar de arter som är beroende av ängarna och försörjningen av herdarna. Detsamma kan ses i Mid-hill och låglandskogar. Boskap betas i hela skogen och tar bort skogens underdrift; skadar sammansättningen av de naturliga ekosystemen och tillhörande biologisk mångfald.,
kommersiell handel
kommersiell insamling av växter som används i traditionell medicin utgör också ett hot mot vissa arter och den naturliga sammansättningen av vissa livsmiljöer.