viruset MERS-CoV är medlem i beta-gruppen av coronavirus, Betacoronavirus, lineage C. MERS-CoV genomer är fylogenetiskt klassificerade i två klader, clade A och B. De tidigaste fallen av MERS var av clade a-kluster (EMC/2012 och Jordan-N3/2012), och nya fall är genetiskt distinkta (clade B).
MERS-CoV är en av sju kända coronavirus för att infektera människor, includingHCoV-229E,HCoV-NL63,HCoV-OC43,HCoV-HKU1, den originalSARS-CoV (eller SARS-CoV-1), och SARS-CoV-2., MERS-CoV är skild från SARS-coronavirus och skiljer sig från den gemensamma kalla coronavirus och kända endemiska mänskliga betacoronaviruses HCoV-OC43 och HCoV-HKU1. Fram till 23 maj 2013 hade MERS-CoV ofta kallats som ett SARS-liknande virus, eller helt enkelt det nya coronaviruset, och tidigare kallades det vardagligt på messageboards som ”Saudi SARS”.
från och med november 2019 har 2,494 fall av MERS rapporterats med 858 dödsfall, så fallet dödsfall är >30%. 182 Genom har sekvenserats av 2015 (94 från människor och 88 Från dromedary kameler)., Alla sekvenser är>99% liknande. Genomerna kan delas in i två klader – A och B – med de flesta fall som orsakas av clade B. mänskliga och kamelstammar är blandade vilket tyder på flera överföringshändelser.
OriginEdit
det första bekräftade fallet rapporterades i Jeddah, Saudiarabien i April 2012. Egyptisk virolog Ali Mohamed Zaki isolerade och identifierade ett tidigare okänt coronavirus från människans lungor. Zaki publicerade sedan sina resultat på 24 September 2012 på ProMED-mail., De isolerade cellerna visade cytopatiska effekter (CPE), i form av avrundning och syncytibildning.
ett andra fall hittades i September 2012, en 49-årig man som bor i Qatar presenterade liknande influensasymtom, och en sekvens av viruset var nästan identisk med den i det första fallet. I November 2012 uppträdde liknande fall i Qatar och Saudiarabien. Ytterligare fall noterades, med dödsfall associerade, och snabb forskning och övervakning av detta nya coronavirus började.,Det är inte säkert om infektionerna är resultatet av en enda zoonotisk händelse med efterföljande överföring från människa till människa, eller om de flera geografiska infektionsställena representerar flera zoonotiska händelser från en okänd gemensam källa.
en studie av Ziad Memish från Riyad University och kollegor föreslår att viruset uppstod någon gång mellan juli 2007 och juni 2012, med kanske så många som 7 separata zoonotiska överföringar., Bland djurreservoarer har CoV en stor genetisk mångfald, men proverna från patienter föreslog ett liknande genom, och därför vanlig källa, även om data var begränsade. Det bestämdes genom molekylär klockanalys att virus från EMC / 2012 och England / Qatar / 2012 datum till början av 2011, vilket tyder på att dessa fall härstammade från en enda zoonotisk händelse. Det visade sig att MERS-CoV hade cirkulerat i den mänskliga befolkningen i mer än ett år utan upptäckt och föreslog oberoende överföring från en okänd källa.,
TropismEdit
MERS-CoV: struktur, bilaga, ingång och genomisk sammansättning
hos människor har viruset en stark tropism för icke-cilierade bronkialepitelceller, och det har visat sig effektivt undvika de medfödda immunsvar och motverka interferon (IFN) produktion i dessa celler. Denna tropism är unik genom att de flesta respiratoriska virus riktar cilierade celler.,
på grund av den kliniska likheten mellan MERS-CoV och SARS-CoV föreslogs att de kan använda samma cellulära receptor; exopeptidas, angiotensinomvandlande enzym 2 (ACE2). Det upptäcktes emellertid senare att neutralisering av ACE2 med rekombinanta antikroppar inte förhindrar MERS-CoV-infektion. Ytterligare forskning identifieras dipeptidylpeptidas 4 (DPP4, även känd som CD26) som en funktionell cellulär receptor för MERS-CoV. Till skillnad från andra kända coronavirusreceptorer krävs inte den enzymatiska aktiviteten hos DPP4 för infektion., Som förväntat är aminosyrasekvensen för DPP4 mycket bevarad över arter och uttrycks i det mänskliga bronkialepitelet och njurarna. Bat DPP4-gener verkar ha varit föremål för en hög grad av adaptiv utveckling som ett svar på koronavirusinfektioner, så linjen som leder till MERS-CoV kan ha cirkulerat i bat-populationer under lång tid innan de överförs till människor.
TransmissionEdit
den 13 februari 2013 uppgav Världshälsoorganisationen att ”risken för långvarig överföring från person till person verkar vara mycket låg.,”Cellerna MERS-CoV infekterar i lungorna står bara för 20% av respiratoriska epitelceller, så ett stort antal virioner är sannolikt nödvändiga för att inandas för att orsaka infektion.
Dr Anthony S. Fauci från National Institutes of Health i Bethesda, Maryland, uppgav att från och med nu MERS-CoV ”inte sprids i en ihållande person till person sätt alls.”Dr. Fauci uppgav att det finns potentiell fara genom att det är möjligt för viruset att mutera till en stam som sänder från person till person.,
infektionen hos vårdpersonal (HCW) har dock lett till oro för mänsklig till mänsklig överföring.
Centers for Disease Control and Prevention (CDC) listar MERS som överförbara från människa till människa. Från deras FAQ, som svar på frågan ”sprider MERS-CoV från person till person?”, de svarar ” MERS-CoV har visat sig sprida sig mellan människor som är i nära kontakt. Överföring från infekterade patienter till vårdpersonal har också observerats. Kluster av fall i flera länder undersöks.,”Det finns också en New York Times artikel som ger några korrelativa sammanhang för detta.
den 28 maj avslöjade CDC att Illinois-mannen som ursprungligen troddes ha varit den första förekomsten av person till person sprids (från Indiana-mannen vid ett affärsmöte) hade faktiskt testat negativt för MERS-CoV. Efter att ha slutfört ytterligare och mer definitiva tester med hjälp av en neutraliserande antikroppstest har experter på CDC dragit slutsatsen att Indiana-patienten inte spredde viruset till Illinois-patienten., Tester drog slutsatsen att Illinois mannen inte tidigare hade smittats. Det är möjligt för tysta MERS att inträffa, det är när patienten inte utvecklar symtom. Tidig forskning har visat att upp till 20% av fallen inte visar några tecken på aktiv infektion men har MERS-CoV-antikroppar i blodet.
EvolutionEdit
3D-modell av ett MERS-CoV spike protein
viruset verkar ha sitt ursprung i fladdermöss. Viruset i sig har isolerats från en fladdermus., Detta virus är nära besläktat med Tylonycteris bat coronaviruset HKU4 och Pipistrellus bat coronaviruset HKU5. Serologiska bevis visar att dessa virus har infekterat kameler i minst 20 år. Den senaste gemensamma förfader till flera mänskliga stammar har daterats till mars 2012 (95% konfidensintervall December 2011 till juni 2012).
de bevis som hittills finns tillgängliga tyder på att virusen har funnits i fladdermöss under en tid och hade spridit sig till kameler i mitten av 1990-talet. virusen verkar ha spridit sig från kameler till människor i början av 2010-talet., Den ursprungliga bat-värdarten och tiden för initial infektion hos denna art har ännu inte fastställts.
undersökning av sekvenserna av 238 isolat föreslog att detta virus har utvecklats till tre klader som skiljer sig åt i kodonanvändning, värd och geografisk fördelning.
Natural reservoirEdit
tidig forskning föreslog att viruset är relaterat till en som finns i den egyptiska graven bat. I September 2012 spekulerade Ron Fouchier att viruset kan ha sitt ursprung i fladdermöss., Arbete av epidemiologen Ian Lipkin vid Columbia University i New York visade att viruset isolerat från en fladdermus såg ut att vara en match mot viruset som finns hos människor. 2c betacoronaviruses upptäcktes i Nycteris fladdermöss i Ghana och fladdermöss Pipistrellus i Europa som är fylogenetiskt relaterade till MERS-CoV virus., Men den stora naturliga reservoaren där människor får virusinfektionen var okänd fram till den 9 augusti 2013, en rapport i tidskriften The Lancet Infectious Diseases visade att 50 av 50 (100%) blodserum från Omani-kameler och 15 av 105 (14%) från Spanska kameler hade proteinspecifika antikroppar mot MERS-CoV spike-proteinet. Blodserum från Europeiska får, getter, nötkreatur och andra kamelider hade inga sådana antikroppar.
Snart efter den 5 September 2013 en seroepidemiological studie som publiceras i tidskriften Eurosurveillance av R. En Perera et al., där de undersökte 1343 human-och 625 djurserum indikerade den rikliga närvaron av MERS-CoV-specifik antikropp i 108 av 110 egyptiska dromedära kameler men inte hos andra djur såsom getter, kor eller får i denna region. Dessa är de första och betydande vetenskapliga rapporterna som indikerade rollen som ”dromedary camels” som en reservoar av MERS-CoV.
senaste arbete länkar kameler till viruset. En före-av-tryck sändning för tidskriften Emerging Infectious Diseases records forskning som visar coronavirusinfektion i dromedary camel kalvar och vuxna, 99.,9% matchning till genomen av mänskliga clade B MERS-CoV.
minst en person som har blivit sjuk med MERS var känd för att ha kommit i kontakt med kameler eller nyligen drack kamelmjölk.
länder som Saudiarabien och Förenade Arabemiraten producerar och konsumerar stora mängder kamelkött. Möjligheten finns att Afrikanska eller Australiska fladdermöss hamn viruset och överföra den till kameler. Importerade kameler från dessa regioner kan ha fört viruset till Mellanöstern.,
under 2013 identifierades MERS-CoV i tre medlemmar av en dromedär kamelhjord som hölls i en Qatar-Lada, som var kopplad till två bekräftade mänskliga fall som sedan har återhämtat sig. Närvaron av MERS-CoV i kamelerna bekräftades av National Institute of Public Health and Environment (RIVM) vid hälsovårdsministeriet och Erasmus Medical Center (WHO Collaborating Center), Nederländerna. Ingen av kamelerna visade några tecken på sjukdom när proverna samlades in., Qatar Supreme Council of Health rådde i November 2013 att personer med underliggande hälsoförhållanden, såsom hjärtsjukdomar, diabetes, njursjukdom, respiratorisk sjukdom, den immunosuppresserade och äldre, undviker nära djurkontakter när de besöker gårdar och marknader och övar god hygien, såsom att tvätta händerna.,
en ytterligare studie om dromedarkameler från Saudiarabien som publicerades i December 2013 avslöjade närvaron av MERS-CoV i 90% av de utvärderade dromedarkamelerna (310), vilket tyder på att dromedarkameler inte bara kunde vara HUVUDRESERVOAREN av MERS-CoV, utan också djurkällan för MERS.
enligt den 27 mars 2014 stöder MERS-CoV sammanfattningsuppdatering, nyligen genomförda studier att kameler fungerar som den primära källan till MERS-CoV som infekterar människor, medan fladdermöss kan vara virusets ultimata reservoar., Bevis inkluderar frekvensen med vilken viruset har hittats i kameler som mänskliga fall har exponerats för, seriologiska data som visar utbredd överföring i kameler och likheten mellan kamelkoven och den mänskliga CoV.
den 6 juni 2014 lyfte den arabiska nyhetstidningen fram de senaste forskningsresultaten i New England Journal of Medicine där en 44-årig Saudisk man som höll en besättning på nio kameler dog av MERS i November 2013., Hans vänner sa att de bevittnade att han applicerade en aktuell medicin på näsan av en av hans sjuka kameler-fyra av dem rapporterade sjuk med nasal urladdning-sju dagar innan han själv blev drabbad av MERS. Forskare sekvenserade viruset som hittades i en av de sjuka kamelerna och viruset som dödade mannen och fann att deras Genom var identiska. I samma artikel rapporterade Arab News att från och med den 6 juni 2014 har det förekommit 689 fall av MERS rapporterade inom Konungariket Saudiarabien med 283 dödsfall.,
TaxonomyEdit
MERS-CoV är närmare relaterade till bat coronavirus HKU4 och HKU5 (härstamning 2C) än det är att SARS-CoV (härstamning 2B) (2, 9), dela mer än 90% sekvens identitet med sina närmaste relationer, bat coronavirus HKU4 och HKU5 och därför anses tillhöra samma art av Internationella Kommittén på Taxonomy of Viruses (ICTV).,; positiv-känsla, enkelsträngat RNA-virus” – Kommandot: Nidovirales” Familjen: Coronaviridae” Underfamiljen: Coronavirinae” Typ: Betacoronavirus” Arter: Betacoronavirus 1 (vanligen kallad Human coronavirus OC43), Human coronavirus HKU1, Murina coronaviruset, Pipistrellus bat coronaviruset HKU5, Rousettus bat coronaviruset HKU9, Svår akut respiratorisk sjukdom-relaterade coronaviruset, Tylonycteris bat coronaviruset HKU4, KONKURRENSKRAFTIGA-CoV
- Viruset värdar:
- Homo sapiens (människa)
- Kameler
- Fladdermöss
Stammar:
- Isolera:
- Isolera:
- NCBI