I. G. Farben produce gaze toxice în timpul al Doilea Război Mondial. De exemplu, se produce agenților de război tabun și sarin printr-o companie de operare, Anorgana GmbH cu sediul în Ludwigshafen, la Dyhernfurth fabrica de lângă Breslau, Polonia. De asemenea, produce gazul de muștar al agentului de război la Gendorf, situat în Bavaria.Zyklon B este un gaz toxic din Cianura de hidrogen, care este folosit în camerele de gazare din lagărele de concentrare naziste din 1941 pentru a ucide sistematic mult mai mult de un milion de victime, majoritatea evrei., Dezvoltat inițial ca pesticid, Zyklon B este vândut de Deutsche Gesellschaft für Schädlingsbekämpfung mbH (Degesch) fondat în 1919; companiile sale de vânzări preiau vânzarea Zyklon B din 1930/1931. După începutul războiului (1939), Wehrmacht și SS devin clienți majori ai Degesch și ai companiilor sale de vânzări – nu numai barăcile soldaților, ci și barăcile din lagărele de concentrare trebuie să fie supuse dezinfecției pentru a evita proliferarea paraziților purtători de boli.din 1930, I. G. Farben menține o cotă de 42, 5 la sută în Degesch., Carl Wurster (1900-1974; 1952-1965 președinte al Consiliului de Directori Executivi al re-stabilit BASF) devine un membru al Degesch echivalentul unui consiliu de supraveghere (Verwaltungsausschuss) în 1940. După război (1945) și mai ales în procesele de la Nuremberg, întrebarea este ridicată dacă reprezentanții I. G. Farben știa că Zyklon B a fost folosit pentru uciderea în masă a oamenilor din septembrie 1941. Un răspuns definitiv nu a fost încă găsit.,în orice caz, înregistrările încă păstrate și conturile martorilor nu dau niciun indiciu că Carl Wurster știa despre utilizarea abuzivă a pesticidelor pentru exterminarea în masă industrială. El și ceilalți membri ai Degesch consiliul de supraveghere, care nu a avut nici o perspectivă în de zi cu zi de management de afaceri, nu a recunoscut orice nereguli în cifrele de vânzări pentru Zyklon B. Acest lucru este pentru că pe măsură ce războiul continua, mai multe și mai multe persoane au fost adăpostite în tabere așa că era de așteptat ca cererea s-ar ridica pentru pediculicides și alte pesticide., În plus, vânzările efective ale Zyklon B nu au fost semnificativ mai mari după execuțiile în masă de la Auschwitz începute în septembrie 1941 decât erau înainte. Wurster este achitat de toate acuzațiile în 1948.
în Plus, un nou studiu concluzionează că, chiar și după participarea altor companii (1930), Degesch ” o parte integrantă a Degussa de întreprindere și nu de I. G. Farben, așa cum a fost în mod fals presupune în procese împotriva consiliului de administratie pentru crime de război între 1947 și 1948, și încă se mai crede astăzi.”