Global Justering
Globale verktøy for justering opprette en ende-til-ende-justering av sekvensene som skal justeres.
Nål (RELIEFF)
EMBOSS Nål skaper en optimal global justering av to sekvenser med Needleman-Wunsch algoritme.
Lanseringen Nål
Båre (RELIEFF)
EMBOSS Båre bruker en modifikasjon av Needleman-Wunsch algoritme som gir større sekvenser for å være globalt justert.,
Lanseringen Båre
Lokal Justering
Lokale verktøy for justering finne en, eller flere, justeringer som beskriver den som er mest lik regionen(s) i sekvenser som skal justeres. De kan justere protein og nukleotide-sekvenser.
Vann (RELIEFF)
EMBOSS Vann bruker Smith-Waterman-algoritmen (modifisert for hastigheten ekstrautstyr) for å beregne den lokale justering av to sekvenser.
Lanseringen Vann
Matcher (RELIEFF)
EMBOSS Brudd identifiserer lokale likheter mellom to sekvenser ved hjelp av en streng algoritme basert på LALIGN programmet.,
Lanseringen Brudd
LALIGN
LALIGN finner interne duplikater ved beregning av ikke-kryssende lokale justeringer av proteiner eller DNA-sekvenser.
Lanseringen LALIGN