전역 정렬
전역 정렬 도구는 정렬 할 시퀀스의 종단 간 정렬을 만듭니다.
Needle(EMBOSS)
EMBOSS Needle 은 Needleman-Wunsch 알고리즘을 사용하여 두 시퀀스의 최적 전역 정렬을 만듭니다.
실행에 바늘
들것(EMBOSS)
돋을새김 들것을 사용하여 수정 Needleman-를 설립시켰 알고리즘을 수 있는 큰 순서 세계적으로 정렬되어 있습니다.,
실행 들것
로컬 맞춤
로컬 맞춤 도구 하나 이상의,선형을 설명하는 대부분의 유사한 지역(s)내에서 이 순서를 정렬합니다. 그들은 단백질과 뉴클레오티드 서열을 정렬 할 수있다. 물 물(EMBOSS)
EMBOSS Water 는 Smith-Waterman 알고리즘(속도 향상을 위해 수정 됨)을 사용하여 두 시퀀스의 로컬 정렬을 계산합니다.
실행 물
Matcher(EMBOSS)
엠보 정규를 식별하는 로컬 사이에 유사성이 두 개의 시퀀스를 사용하여 엄격한 알고리즘을 기반으로 LALIGN 응용 프로그램.,
실행 Matcher
LALIGN
LALIGN 찾 내부 중복 계산에 의해 교차하지 않는 지역 선형 단백질 또는 DNA sequences.
실행 LALIGN