グローバルアライメント
グローバルアライメントツール
Needle(EMBOSS)
EMBOSS Needleは、Needleman-Wunschアルゴリズムを使用して、二つのシーケンスの最適なグローバルアライメントを作成します。
Launch Needle
Stretcher(EMBOSS)
EMBOSS Stretcherは、より大きなシーケンスをグローバルに整列させることを可能にするNeedleman-Wunschアルゴリズムの修正を使用します。,
Launch Stretcher
Local Alignment
Local alignmentツールは、整列するシーケンス内の最も類似した領域を記述する一つまたは複数の整列を検索します。 それらは蛋白質およびヌクレオチド配列を一直線に並べ
Water(EMBOSS)
EMBOSS Waterは、スミス-ウォーターマンアルゴリズム(速度向上のために修正)を使用して、二つのシーケンスの局所アライメントを計算します。
Launch Water
Matcher(EMBOSS)
EMBOSS Matcherは、LALIGNアプリケーションに基づく厳密なアルゴリズムを使用して、二つのシーケンス間の局所的類似性を識別します。,
Launch Matcher
LALIGN
LALIGNは、タンパク質またはDNA配列の非交差ローカルアライメントを計算することによって、内部の重複を検出します。
Lalignを起動します