パルパティーン首相の支配の最初の十年の間に、ドゥークー伯爵は分離主義運動の顔として浮上し、彼の原因にシステムを集 ジオノーシスでは、彼は他の指導者と共謀して、共和国を圧倒する大規模なドロイド軍を建設した。 しかし、彼はオビ＝ワン-ケノービがミッション中にシステムに向かったことに驚いた。, ジェダイが捕らえられると、ドゥークーは彼に会えてうれしいと主張した-Qui-Gon Jinnの元マスターとして、ドゥークーはObi-Wanについて良いことしか聞いていなかった-と彼の助けを求めた。 Dookuが分離主義者に加わった理由は、darth Sidiousと呼ばれるSith Lordが上院を支配したという恐ろしい真実を学んだからであると彼は言いました。 オビ＝ワンがそばにいれば、シスを破壊することができた。 “私はあなたに加わることは決してない、ドゥークー、”ジェダイは言った。 ドゥークーは冷たくオビ＝ワンを独房に残した。,
その後、ドゥークーとジオノシアンはオビ＝ワン、アナキン-スカイウォーカー、パドメ-アミダラを大規模なアリーナで処刑することを計画した。 しかし、三人はジェダイと新しいクローン軍に攻撃を仕掛ける時間を与えた。 したがって、クローン戦争の始まりを告げ、両軍は大きな損失を被った。
ドゥークーは逃げるためにスピーダーに乗って近くの格納庫に行ったが、オビ＝ワンとアナキンが続いた。, 分離主義者のリーダーは赤い刃のライトセーバーに火をつけた-彼は実際にシスを回していたという証拠-そして、フォースライトニングの強力なショットでアナキンを打った。 傲慢で戦闘に熱心であった彼は両者を嘲笑し、最終的にオビ＝ワンを負傷させ、アナキンの右腕を切断した。 ジェダイを終わらせる準備ができて、ドゥークーはおなじみの足音を聞いたときに止まった：ヨーダが到着した。 シスはどのジェダイよりも強力であると主張したが、ヨーダは彼の力の雷攻撃を簡単に吸収した。 “多くのことを学びまだ”と彼は言った。, それにより、二人は激しいライトセーバーの決闘を戦い、ドゥークーは急いで出口を作ることで終わった。 “これはほんの始まりに過ぎない”と彼は警告した。 元ジェダイはシステムを逃れ、邪悪なダース-シディアスに迎えられたコルサントのマークされていない住居に着陸した。 “私はあなたのために良いニュースを持って、私の主、”彼は言った。 “戦争が始まった。”