ウイルスMERS-CoVは、コロナウイルス、ベータコロナウイルス、系統CのベータグループのメンバーであるMERS-CoVゲノムは、系統学的に二つのクレード、クレードAとBに分類される。

MERS-CoVは、hcov-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43、HCoV-HKU1、オリジナルのsars-CoV(またはSARS-CoV-1)、SARS-CoV-2を含む、人々に感染する七つの既知のコロナウイルスの一つである。, MERS-CoVはsarsコロナウイルスとは異なり、一般的な風邪コロナウイルスおよび既知の風土病ヒトベータコロナウイルスHCoV-OC43およびHCoV-HKU1とは異なります。 23May2013まで、MERS-CoVはしばしばSARS様ウイルス、または単に小説コロナウイルスと呼ばれていましたが、以前は”Saudi SARS”としてメッセージボード上で口語的に呼ばれていました。

2019年現在、MERSの症例は2,444例で858人の死亡が報告されているため、死亡率は>30%である。 182個のゲノムが2015年までに配列決定されている(ヒトから94個、ドロメダリーラクダから88個)。, すべてのシーケンスは>99%類似しています。 ゲノムは二つのクレードに分けることができます-AとB-クレードBによって引き起こされるケースの大部分とヒトとラクダの株は、複数の伝達イベントを

OriginEdit

最初に確認されたケースは、2012年にサウジアラビアのジッダで報告されました。 エジプトのウイルス学者Ali Mohamed Zakiは、男性の肺から以前に未知のコロナウイルスを単離し、同定した。 ザキはその後、24September2012に彼の調査結果をProMED-mailに投稿しました。, 単離された細胞は,丸形および合胞体形成の形で細胞変性効果(CPE)を示した。

2012年にカタールに住む49歳の男性が同様のインフルエンザ症状を呈し、ウイルスのシーケンスは最初の症例とほぼ同じであった。 2012年には、カタールとサウジアラビアで同様のケースが登場した。 追加の症例が認められ、死亡が関連し、この新規コロナウイルスの迅速な研究と監視が始まりました。,感染がその後のヒトからヒトへの感染を伴う単一の人獣共通感染症の結果であるかどうか、または感染の複数の地理的部位が未知の共通のソースからの複数の人獣共通感染症のイベントを表しているかどうかは定かではありません。

リヤド大学のZiad Memishらによる研究では、このウイルスは2007年から2012年の間に発生し、おそらく7つの別々の人獣共通感染症の感染があったことが示唆されている。, 動物貯留層の中で、CoVは大きな遺伝的多様性を有するが、患者からのサンプルは同様のゲノムを示唆し、したがって共通の情報源を示唆したが、データは限られていた。 分子時計解析により、EMC/2012およびEngland/Qatar/2012のウイルスは2011年初頭までの日付であることが判明し、これらの症例は単一の人獣共通感染事象の子孫であることが示唆された。 MERS-CoVは検出されずに一年以上にわたってヒト集団内を循環しており、未知の供給源からの独立した伝達を示唆していたようであった。,

TropismEdit

MERS-CoV:構造、添付ファイル、入り口、およびゲノム組成

ヒトでは、ウイルスは非関連気管支上皮細胞に対して強い向性を有し、これらの細胞における自然免疫応答を効果的に回避し、インターフェロン(IFN)産生を拮抗することが示されている。 この傾向は、ほとんどの呼吸器ウイルスが繊毛細胞を標的とする点でユニークである。,

MERS-CoVとSARS-CoVの臨床的類似性のために、エキソペプチダーゼ、アンジオテンシン変換酵素2(ACE2)という同じ細胞受容体を使用することが提案された。 しかしながら、組換え抗体によるACE2の中和は、MERS-CoV感染を予防しないことが後に発見された。 さらなる研究は、MERS-CoVの機能性細胞受容体としてジペプチジルペプチダーゼ4(DPP4;CD26としても知られている)を同定した。 他の既知のコロナウイルス受容体とは異なり、DPP4の酵素活性は感染に必要ではありません。, 予想されるように、DPP4のアミノ酸配列は、種間で高度に保存され、ヒト気管支上皮および腎臓で発現される。 コウモリDPP4遺伝子は、コロナウイルス感染への応答として高度な適応進化を受けているように見えるので、MERS-CoVにつながる系統は、人々に伝達される前に長い期間、コウモリ集団で循環していた可能性がある。

TransmissionEdit

13February2013では、世界保健機関は、”持続的な人から人への感染のリスクは非常に低いように見える”と述べました。,”Mers-CoVが肺に感染する細胞は呼吸器上皮細胞の20%しか占めていないため、感染を引き起こすためには多数のビリオンを吸入する必要がある可能性が

メリーランド州ベセスダの国立衛生研究所のAnthony S.Fauci博士は、現在のところMERS-CoVは”持続的な人から人への道ではまったく広がっていない”と述べている。”博士Fauciは、ウイルスが人から人へ伝達する株に変異する可能性があるという点で潜在的な危険があると述べた。,

しかし、医療従事者(HCW)の感染は、ヒトからヒトへの感染の懸念につながっている。疾病管理予防センター(CDC)は、MERSをヒトからヒトへの伝達性としてリストしている。 彼らのFAQから、質問への答えで”MERS-CoVは人から人へ広がっていますか?”、彼らは答える”mers-CoVは密接に接触している人々の間で広がることが示されています。 感染した患者から医療従事者への伝達も観察されている。 いくつかの国での症例のクラスターが調査されている。,”このためのいくつかの相関的な文脈を提供するニューヨークタイムズの記事もあります。

しかし、月の28日に、CDCは、もともと人から人への広がりの最初の発生率であると考えられていたイリノイ州の男性(ビジネスミーティングでインディアナ州の男から)は、実際にはMERS-CoVの陰性をテストしていたことを明らかにした。 中和抗体アッセイを使用して追加の、より決定的なテストを完了した後、CDCの専門家は、インディアナ州の患者がイリノイ州の患者にウイルスを広, 試験の結果、イリノイマったことのない感染した。 サイレントMERSが発生する可能性がありますが、これは患者が症状を発症しない場合です。 初期の研究では、最大20%の症例が活性感染の兆候を示さないが、血液中にMERS-CoV抗体を有することが示されている。

EvolutionEdit

MERS-CoVスパイクタンパク質の3Dモデル

このウイルスはコウモリに由来するようです。 ウイルス自体はコウモリから分離されています。, このウイルスは密接にTylonycterisコウモリコロナウイルスHKU4とPipistrellusコウモリコロナウイルスHKU5に関連しています。 血清学的証拠によるとこれらのウイルスに感染していラクダの少なくとも20年間です。 いくつかのヒト株の最新の共通祖先は、March2012(95%信頼区間December2011to June2012)に日付が付けられています。

これまでに得られた証拠から、このウイルスはしばらくコウモリに存在し、1990年代半ばまでにラクダに広がっていたことが示唆され、2010年代初頭にラクダからヒトに広がっていたようである。, 元のコウモリの宿主種とこの種の最初の感染の時期はまだ決定されていません。

238の分離株の配列の検討は、このウイルスは、コドンの使用、ホスト、および地理的分布が異なる三つのクレードに進化していることを示唆した。

Natural reservoirEdit

初期の研究では、このウイルスはエジプトの墓コウモリで見つかったものと関連していることが示唆されていました。 2012年、ロン-フーシエはこのウイルスがコウモリに由来する可能性があると推測した。, ニューヨークのコロンビア大学の疫学者Ian Lipkinによる研究は、コウモリから分離されたウイルスが人間で見つかったウイルスと一致するように見えたことを示しました。 2cベータコロナウイルスは、系統発生的にMERS-CoVウイルスに関連しているガーナのNycterisコウモリとヨーロッパのPipistrellusコウモリで検出されました。, しかし、ヒトがウイルス感染を受ける主要な自然貯留層は9月に2013年まで不明のままであり、ランセット感染症誌の報告によると、オマーンのラクダからの50のうち50(100%)の血清とスペインのラクダからの15の105(14%)がMERS-CoVスパイクタンパク質に対するタンパク質特異的抗体を持っていたことが示された。 ヨーロッパの羊、ヤギ、牛、および他のラクダからの血清は、そのような抗体を持っていませんでした。

すぐ後に5九月2013r.A PereraらによってEurosurveillanceのジャーナルに掲載された血清疫学的研究., 彼らが1343人のヒトおよび625動物の血清を調査したところ、この地域のヤギ、牛またはヒツジのような他の動物ではなく、108のエジプトのdromedaryラクダの110のmers-CoV特異的抗体の豊富な存在が示された。 これらは、MERS-CoVの貯水池としての”dromedaryラクダ”の役割を示した最初の重要な科学的報告です。

最近の研究では、ラクダをウイルスにリンクしています。 ジャーナル新興感染症のための印刷の派遣は、dromedaryラクダの子牛と成人、99におけるコロナウイルス感染を示す研究を記録しています。,9%はヒトクレードB MERS-CoVのゲノムと一致している。

MERSで病気になった少なくとも一人は、ラクダと接触したり、最近ラクダミルクを飲んだことが知られていました。

サウジアラビアやアラブ首長国連邦のような国は、大量のラクダ肉を生産し、消費しています。 アフリカやオーストラリアのコウモリがウイルスを保有し、ラクダに送信する可能性が存在します。 これらの地域から輸入されたラクダは、ウイルスを中東に運んだ可能性があります。,

2013年にMERS-CoVは、カタールの納屋で開催されたdromedaryラクダの群れの三つのメンバーで同定されました。 ラクダにおけるMERS-CoVの存在は、保健省の国立公衆衛生環境研究所(RIVM)およびオランダのエラスムス医療センター(WHO協力センター)によって確認された。 試料を採取したとき,ラクダはいずれも病気の徴候を示さなかった。, 2013年、カタール最高保健評議会は、心臓病、糖尿病、腎臓病、呼吸器疾患、免疫抑制、高齢者などの基礎となる健康状態を持つ人々は、農場や市場を訪問する際に動物との密接な接触を避け、手洗いなどの良好な衛生を実践することを勧告した。,

2013年に発表されたサウジアラビアのドロメダリーラクダに関するさらなる研究では、評価されたドロメダリーラクダの90%(310)にMERS-CoVの存在が明らかになり、ドロメダリーラクダがMERS-CoVの主な貯水池であるだけでなく、MERSの動物源でもあることが示唆された。

27March2014MERS-CoV summary updateによると、最近の研究では、ラクダがヒトに感染するMERS-CoVの主要な供給源として機能することが支持されていますが、コウモリはウイルスの究極の貯蔵庫である可能性があります。, 証拠には、ヒトの症例が暴露されたラクダでウイルスが発見された頻度、ラクダで広範な感染を示すseriologicalデータ、およびラクダCoVとヒトCoVとの類似性が含まれる。

6月2014年、アラブニュース紙はニューイングランド-ジャーナル-オブ-メディシンの最新の研究成果を強調し、44歳のサウジアラビア人が2013年にラクダの群れを飼っていたことを明らかにした。, 彼の友人は、彼が病気のラクダの一つの鼻に局所薬を適用するのを目撃したと言いました—彼らのうち四人は鼻汁で病気だと伝えられています—彼自身がMERSに襲われる七日前に。 研究者は、病気のラクダの一つで見つかったウイルスと男を殺したウイルスを配列決定し、そのゲノムが同一であることを発見しました。 その同じ記事では、アラブニュースは、6June2014の時点で、サウジアラビア王国内で689人のMERSが報告され、283人が死亡したと報告した。,

TaxonomyEdit

MERS-CoVは、sars-CoV(lineage2B)(2,9)よりもコウモリコロナウイルスHKU4およびHKU5(lineage2C)と密接に関連しており、90%以上の配列同一性を最も近い関係であるコウモリコロナウイルスHKU4およびHKU5と共有しているため、国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって同じ種に属すると考えられている。, ポジティブセンス、一本鎖RNAウイルス”コマンド:ニドウィラレス”ファミリー:コロナウイルス”サブファミリー:コロナウイルス”タイプ:ベータコロナウイルス”種:ベータコロナウイルス1(一般にヒトコロナウイルスOC43と呼ばれる)、ヒトコロナウイルスHKU1、マウスコロナウイルス、ピピストレルスコロナウイルスHKU5、ルーセトゥスコロナウイルスHKU9、重症急性呼吸器症候群関連コロナウイルス、タイロニクテリスコロナウイルスhku4,competitive-cov

  • ウイルスホスト:
    • ホモサピエンス(ヒト)
    • ラクダ
    • コウモリ

株:

  • 分離株:
  • 分離株:
  • ncbi

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