Il virus MERS-CoV è un membro del gruppo di beta del coronavirus, Betacoronavirus, lignaggio C. MERS-CoV genomi sono filogeneticamente classificati in due cladi, clade A e B. I primi casi di MERS sono stati di clade Un cluster (EMC/2012 e Giordania-N3/2012), e i nuovi casi sono geneticamente distinti (clade B).

MERS-CoV è uno dei sette coronavirus noti per infettare le persone, includingHCoV-229E,HCoV-NL63,HCoV-OC43,HCoV-HKU1, l’originalSARS-CoV (o SARS-CoV-1) e SARS-CoV-2., MERS-CoV è distinto dal coronavirus di SARS e distinto dal coronavirus comune-freddo e dal betacoronavirus umano endemico conosciuto HCoV-OC43 e HCoV-HKU1. Fino al 23 maggio 2013, MERS-CoV era stato spesso indicato come un virus simile alla SARS, o semplicemente il nuovo coronavirus, e in precedenza è stato definito colloquialmente sui pannelli dei messaggi come “SARS saudita”.

A partire da novembre 2019, sono stati segnalati 2.494 casi di MERS con 858 decessi, quindi il tasso di mortalità dei casi è> 30%. 182 genomi sono stati sequenziati entro il 2015 (94 da esseri umani e 88 da cammelli dromedari)., Tutte le sequenze sono>99% simili. I genomi possono essere divisi in due cladi – A e B – con la maggior parte dei casi causati da clade B. Ceppi umani e camel sono mescolati suggerendo più eventi di trasmissione.

OriginEdit

Il primo caso confermato è stato segnalato a Jeddah, in Arabia Saudita nell’aprile 2012. Il virologo egiziano Ali Mohamed Zaki ha isolato e identificato un coronavirus precedentemente sconosciuto dai polmoni dell’uomo. Zaki ha poi pubblicato le sue scoperte su 24 September 2012 su ProMED-mail., Le cellule isolate hanno mostrato effetti citopatici (CPE), sotto forma di arrotondamento e formazione di sincitia.

Un secondo caso è stato trovato nel settembre 2012, un maschio di 49 anni che viveva in Qatar si presentava con sintomi influenzali simili e una sequenza del virus era quasi identica a quella del primo caso. Nel novembre 2012, casi simili sono comparsi in Qatar e Arabia Saudita. Sono stati notati ulteriori casi, con decessi associati, e sono iniziate una rapida ricerca e monitoraggio di questo nuovo coronavirus.,Non è certo se le infezioni siano il risultato di un singolo evento zoonotico con successiva trasmissione da uomo a uomo, o se i siti geografici multipli di infezione rappresentino eventi zoonotici multipli provenienti da una fonte comune sconosciuta.

Uno studio condotto da Ziad Memish dell’Università di Riyadh e colleghi suggerisce che il virus è sorto a volte tra luglio 2007 e giugno 2012, con forse ben 7 trasmissioni zoonotiche separate., Tra i serbatoi animali, CoV ha una grande diversità genetica, ma i campioni dei pazienti hanno suggerito un genoma simile, e quindi una fonte comune, anche se i dati erano limitati. È stato determinato attraverso l’analisi dell’orologio molecolare che i virus dell’EMC / 2012 e dell’Inghilterra / Qatar / 2012 risalgono all’inizio del 2011, suggerendo che questi casi discendevano da un singolo evento zoonotico. Sembrava che il MERS-CoV fosse circolato nella popolazione umana per più di un anno senza rilevamento e suggeriva una trasmissione indipendente da una fonte sconosciuta.,

TropismEdit

MERS-CoV: struttura, l’attaccamento, l’ingresso, la genomica e la composizione

Negli esseri umani, il virus ha uno spiccato tropismo per i nonciliated cellule epiteliali bronchiali, ed è stato dimostrato in modo efficace eludere la risposta immunitaria innata e antagonizzare l’interferone (IFN) la produzione di queste cellule. Questo tropismo è unico in quanto la maggior parte dei virus respiratori colpiscono le cellule ciliate.,

A causa della somiglianza clinica tra MERS-CoV e SARS-CoV, è stato proposto che possano utilizzare lo stesso recettore cellulare; l’esopeptidasi, enzima di conversione dell’angiotensina 2 (ACE2). Tuttavia, è stato successivamente scoperto che la neutralizzazione di ACE2 da parte degli anticorpi ricombinanti non impedisce l’infezione da MERS-CoV. Ulteriori ricerche hanno identificato la dipeptidil peptidasi 4 (DPP4; noto anche come CD26) come recettore cellulare funzionale per MERS-CoV. A differenza di altri recettori noti del coronavirus, l’attività enzimatica di DPP4 non è richiesta per l’infezione., Come ci si aspetterebbe, la sequenza aminoacidica di DPP4 è altamente conservata tra le specie ed è espressa nell’epitelio bronchiale umano e nei reni. I geni Bat DPP4 sembrano essere stati soggetti ad un alto grado di evoluzione adattativa come risposta alle infezioni da coronavirus, quindi il lignaggio che porta a MERS-CoV potrebbe essere circolato nelle popolazioni di pipistrelli per un lungo periodo di tempo prima di essere trasmesso alle persone.

Trasmissionedit

Il 13 febbraio 2013, l’Organizzazione Mondiale della Sanità ha dichiarato che “il rischio di trasmissione prolungata da persona a persona sembra essere molto basso.,”Le cellule che MERS-CoV infetta nei polmoni rappresentano solo il 20% delle cellule epiteliali respiratorie, quindi è probabile che un gran numero di virioni debba essere inalato per causare l’infezione.

Il Dr. Anthony S. Fauci del National Institutes of Health di Bethesda, nel Maryland, ha dichiarato che al momento il MERS-CoV “non si diffonde in modo sostenuto da persona a persona. Fauci ha dichiarato che esiste un potenziale pericolo in quanto è possibile che il virus si trasformi in un ceppo che trasmette da persona a persona.,

Tuttavia, l’infezione degli operatori sanitari (HCW) ha portato a preoccupazioni di trasmissione da uomo a uomo.

I Centri per il controllo e la prevenzione delle malattie (CDC) elencano le MER come trasmissibili da uomo a uomo. Dalle loro FAQ, in risposta alla domanda ” MERS-CoV si diffonde da persona a persona?”, rispondono ” MERS-CoV ha dimostrato di diffondersi tra le persone che sono in stretto contatto. È stata inoltre osservata la trasmissione da pazienti infetti al personale sanitario. Sono allo studio gruppi di casi in diversi paesi.,”C’è anche un articolo del New York Times che fornisce un contesto correlativo per questo.

Tuttavia, il 28 maggio, il CDC ha rivelato che l’uomo dell’Illinois che originariamente si pensava fosse la prima incidenza di diffusione da persona a persona (dall’uomo dell’Indiana in una riunione di lavoro), era infatti risultato negativo per MERS-CoV. Dopo aver completato test aggiuntivi e più definitivi utilizzando un test di anticorpi neutralizzanti, gli esperti del CDC hanno concluso che il paziente dell’Indiana non ha diffuso il virus al paziente dell’Illinois., I test hanno concluso che l’uomo dell’Illinois non era stato precedentemente infettato. È possibile che si verifichino MERS silenziosi, questo è quando il paziente non sviluppa sintomi. Le prime ricerche hanno dimostrato che fino al 20% dei casi non mostrano segni di infezione attiva, ma hanno anticorpi MERS-CoV nel sangue.

EvolutionEdit

Modello 3D di una proteina spike MERS-CoV

Il virus sembra aver avuto origine nei pipistrelli. Il virus stesso è stato isolato da un pipistrello., Questo virus è strettamente correlato al Tylonycteris bat coronavirus HKU4 e Pipistrellus bat coronavirus HKU5. Le prove sierologiche mostrano che questi virus hanno infettato i cammelli per almeno 20 anni. L’antenato comune più recente di diversi ceppi umani è stato datato a marzo 2012 (intervallo di confidenza del 95% da dicembre 2011 a giugno 2012).

Le prove disponibili fino ad oggi suggerisce che i virus sono stati presenti nei pipistrelli per qualche tempo e si era diffuso ai cammelli entro la metà degli anni 1990. I virus sembrano essersi diffuse dai cammelli agli esseri umani nei primi anni 2010., La specie ospite di pipistrello originale e il momento dell’infezione iniziale in questa specie devono ancora essere determinati.

L’esame delle sequenze di 238 isolati ha suggerito che questo virus si è evoluto in tre cladi differenti nell’uso del codone, nell’ospite e nella distribuzione geografica.

Riserva naturaledit

Le prime ricerche hanno suggerito che il virus è correlato a quello trovato nella tomba egiziana bat. Nel mese di settembre 2012 Ron Fouchier ha ipotizzato che il virus potrebbe aver avuto origine nei pipistrelli., Il lavoro dell’epidemiologo Ian Lipkin della Columbia University di New York ha mostrato che il virus isolato da un pipistrello sembrava corrispondere al virus trovato negli esseri umani. 2c betacoronavirus sono stati rilevati nei pipistrelli Nycteris in Ghana e Pipistrellus pipistrelli in Europa che sono filogeneticamente correlati al virus MERS-CoV., Tuttavia, il principale serbatoio naturale in cui gli esseri umani contraggono l’infezione da virus è rimasto sconosciuto fino a quando il 9 agosto 2013, un rapporto sulla rivista The Lancet Infectious Diseases ha mostrato che 50 su 50 (100%) siero di sangue dai cammelli dell’Oman e 15 su 105 (14%) dai cammelli spagnoli avevano anticorpi specifici per le proteine contro la proteina spike MERS-CoV. Il siero di sangue di pecore, capre, bovini e altri camelidi europei non aveva tali anticorpi.

Poco dopo il 5 settembre 2013 uno studio sieroepidemiologico pubblicato sul journal of Eurosurveillance da R. A Perera et al., dove hanno studiato 1343 sieri umani e 625 animali hanno indicato, l’abbondante presenza di anticorpi specifici MERS-CoV in 108 su 110 cammelli dromedari egiziani, ma non in altri animali come capre, mucche o pecore in questa regione. Questi sono i primi e significativi rapporti scientifici che indicavano il ruolo dei “cammelli dromedari” come serbatoio di MERS-CoV.

Il lavoro recente collega i cammelli al virus. Un dispaccio anticipato per la rivista Emerging Infectious Diseases registra una ricerca che mostra l’infezione da coronavirus nei vitelli e negli adulti di cammelli dromedari, 99.,il 9% corrisponde ai genomi del clade umano B MERS-CoV.

Almeno una persona che si è ammalata di MERS era nota per essere entrata in contatto con i cammelli o di recente ha bevuto latte di cammello.

Paesi come l’Arabia Saudita e gli Emirati Arabi Uniti producono e consumano grandi quantità di carne di cammello. Esiste la possibilità che i pipistrelli africani o australiani portino il virus e lo trasmettano ai cammelli. I cammelli importati da queste regioni potrebbero aver portato il virus in Medio Oriente.,

Nel 2013 MERS-CoV è stato identificato in tre membri di una mandria di cammelli dromedari detenuti in un fienile del Qatar, che è stato collegato a due casi umani confermati che da allora si sono ripresi. La presenza di MERS-CoV nei cammelli è stata confermata dall’Istituto Nazionale di sanità pubblica e ambiente (RIVM) del Ministero della Salute e dal Centro medico Erasmus (WHO Collaborating Center), nei Paesi Bassi. Nessuno dei cammelli ha mostrato alcun segno di malattia quando sono stati raccolti i campioni., Il Consiglio Supremo della Salute del Qatar ha consigliato nel novembre 2013 che le persone con condizioni di salute sottostanti, come malattie cardiache, diabete, malattie renali, malattie respiratorie, immunosoppressi e anziani, evitano contatti stretti con animali quando visitano fattorie e mercati e praticano una buona igiene, come lavarsi le mani.,

Un ulteriore studio sui cammelli dromedari dall’Arabia Saudita pubblicato nel dicembre 2013 ha rivelato la presenza di MERS-CoV nel 90% dei cammelli dromedari valutati (310), suggerendo che i cammelli dromedari non solo potrebbero essere il principale serbatoio di MERS-CoV, ma anche la fonte animale di MERS.

Secondo il 27 marzo 2014 MERS-COV sommario aggiornamento, recenti studi sostengono che i cammelli servono come fonte primaria del MERS-CoV infettare gli esseri umani, mentre i pipistrelli possono essere il serbatoio finale del virus., Le prove includono la frequenza con cui il virus è stato trovato nei cammelli a cui sono stati esposti casi umani, dati seriologici che mostrano una trasmissione diffusa nei cammelli e la somiglianza del camel CoV con il CoV umano.

Il 6 giugno 2014, il quotidiano Arab News ha evidenziato gli ultimi risultati della ricerca del New England Journal of Medicine in cui un uomo saudita di 44 anni che teneva una mandria di nove cammelli è morto di MERS nel novembre 2013., I suoi amici hanno detto che lo hanno visto applicare una medicina topica al naso di uno dei suoi cammelli malati—quattro di loro riferito malato con secrezione nasale—sette giorni prima che lui stesso è stato colpito con MERS. I ricercatori hanno sequenziato il virus trovato in uno dei cammelli malati e il virus che ha ucciso l’uomo, e hanno scoperto che i loro genomi erano identici. In quello stesso articolo, l’Arab News ha riferito che al 6 giugno 2014, ci sono stati 689 casi di MERS segnalati all’interno del Regno dell’Arabia Saudita con 283 morti.,

Tassonomiaedit

MERS-CoV è più strettamente correlato ai bat coronavirus HKU4 e HKU5 (lineage 2C) che a SARS-CoV (lineage 2B) (2, 9), condividendo più del 90% dell’identità di sequenza con i loro rapporti più stretti, i bat coronavirus HKU4 e HKU5 e quindi considerati appartenenti alla stessa specie dall’International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).,; positivo senso, single-stranded RNA virus” Comando: Nidovirales” Famiglia: Coronaviridae” Sottofamiglia: Coronavirinae” Tipo: Betacoronavirus” Specie: Betacoronavirus 1 (comunemente chiamato coronavirus Umano OC43), coronavirus Umano HKU1, Murino coronavirus, Pipistrellus bat coronavirus HKU5, Rousettus bat coronavirus HKU9, sindrome respiratoria acuta Grave relative coronavirus, Tylonycteris bat coronavirus HKU4, COMPETITIVO-CoV

  • Virus padroni di casa:
    • Homo sapiens (uomo)
    • Cammelli
    • i Pipistrelli

Ceppi:

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  • Isolare:
  • NCBI

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