Global Alignment
Global alignment tools hozzon létre egy end-to-end igazítás a szekvenciák kell igazítani.
Needle (EMBOSS)
EMBOSS Needle létrehoz egy optimális globális összehangolása két szekvencia segítségével Needleman-Wunsch algoritmus.
Launch Needle
Stretcher (EMBOSS)
az EMBOSS Stretcher a Needleman-Wunsch algoritmus módosítását használja, amely lehetővé teszi a nagyobb szekvenciák globálisan igazítását.,
Launch Stretcher
helyi Igazítás
helyi igazítási eszközök egy vagy több, az igazítandó szekvenciákon belül a legtöbb hasonló régiót(régiót) leíró nyomvonalat találnak. Ezek igazíthatják a fehérje-és nukleotidszekvenciákat.
víz (EMBOSS)
az EMBOSS Water A Smith-Waterman algoritmust használja (sebességnövelésre módosítva) két szekvencia helyi igazításának kiszámításához.
Launch Water
Matcher (EMBOSS)
EMBOSS Matcher a lalign alkalmazáson alapuló szigorú algoritmus segítségével azonosítja a két szekvencia közötti helyi hasonlóságokat.,
Launch Matcher
LALIGN
a lalign belső duplikációkat talál a fehérje vagy DNS szekvenciák nem metsző helyi igazításának kiszámításával.
Launch LALIGN