Ha egy gyermeket az élet első néhány hónapjában diagnosztizálnak és kezelnek, mielőtt a gyermeknek súlyos fertőzése van, akkor a hosszú távú túlélési arány több mint 90%. Korai kezelés esetén a SCID-ben szenvedő gyermekek többségének képesnek kell lennie saját működő immunrendszerük fejlesztésére. A SCID-ben szenvedő gyermek kezelésének legjobb módja számos tényezőtől függ, beleértve a SCID típusát, a gyermek egészségét, valamint az orvos ajánlásait.,
a legtöbb SCID-ben szenvedő csecsemőt HSCT-vel vagy csontvelő-transzplantációval kezelik, ami új immunrendszert eredményez, amely képes a fertőzés leküzdésére. A HSCT-ben az orvosok olyan egészséges vérképző sejteket vesznek be, amelyek egy donortól egészséges immunrendszerré fejlődhetnek, és gyermekbe helyezhetik őket. A donor sejtek immunrendszert biztosítanak a gyermeknek.
egy másik kevésbé gyakori, de ígéretes kezelési lehetőség a génterápia, amely jelenleg klinikai vizsgálatokban van. A génterápiában az orvosok kivonják a gyermek hibás vérképző sejtjeit, kijavítják a hibát, és a korrigált sejteket visszahelyezik a gyermekbe., A javított sejtek működő immunrendszert biztosítanak a gyermeknek.
egy harmadik kezelés, enzimpótló terápia, csak ADA-SCID-ben szenvedő gyermekek számára alkalmazható. A enzimpótló terápiában a hiányzó enzimet rendszeresen injektálják SCID-vel a gyermekbe, hogy növeljék az ADA enzimet. Az eredmények ideiglenesek, és nem javítják véglegesen az immunrendszert. Végül az ADA-SCID-ben szenvedő gyermekek hosszú távú eredményekhez HSCT-t vagy génterápiát igényelnek.,
ezeket a kezeléseket megelőzően a SCID-ben szenvedő gyermek antibiotikumokkal, antivirális szerekkel és gombaellenes szerekkel kezdi meg a kezelést a fertőzés megelőzése érdekében. A gyermek immunglobulin-terápiát vagy Ig-t is kap a gyermek immunrendszerének növelésére tervezett antitestek infúziójával. Az Ig-t humán plazmadonorokon keresztül nyerik.