A Szamaritánizmus úgy véli, hogy a Gerizim-hegy csúcsa Isten szent helyének valódi helye, szemben a Templom-hegy Alapkövével, ahogyan a judaizmus tanítja. Mint ilyen, a szamaritánusok nyomon követik történelmüket, mint egy külön egységet a zsidóktól Mózes idejéig, ahol úgy vélik, hogy Józsué megalapozta templomát. A szamaritánus történetírás maga a szakadást követi Eli főpaphoz, aki elhagyja Mózes hajlékát a Gerizim-hegy javára Józsué halála után.,
Abu-l-Fath, aki a 14-ik században írt egy fontos munka, a Szamaritánus története, megjegyzések a Szamaritánus eredetét a következőképpen:
Egy szörnyű polgárháború tört ki közötti Eli fia Yafni, a vonal Ithamár, a fiai Pincus (Phinehas), mert Eli fia Yafni megoldani, hogy megszerezze a főpapság a leszármazottai Pincus. Áldozatokat ajánlott fel a kövek oltárán. 50 éves volt, gazdagsággal felruházva és Izrael gyermekeinek kincstáráért felelt. …,
áldozatot ajánlott az oltáron, de só nélkül, mintha figyelmetlen lenne. Amikor Ozzi nagy főpap tudomást szerzett erről, és úgy találta, hogy az áldozatot nem fogadták el, alaposan kitagadta őt; és (sőt) azt mondta, hogy megdorgálta őt.
ezután ő és a vele szimpatizáló csoport fellázadt, és követőivel és vadállataival együtt elindultak Shiloh felé. Így Izrael szétvált frakciókban. Elküldte a vezetőiknek, mondván nekik, bárki, aki csodálatos dolgokat szeretne látni, hadd jöjjön hozzám., Ezután egy nagy csoportot állított össze körülötte Shiloh – ban, és templomot épített magának ott; épített egy helyet, mint a templom (a Gerizim-hegyen). Oltárt épített, részlet nélkül – mindez megfelelt az eredetinek, darabonként.
ebben az időben Izrael gyermekei három frakcióra oszlottak. Egy hűséges csoport a Gerizim-hegyen; egy eretnek frakció, amely hamis isteneket követett; és a frakció, amely Eli fiát, Yafni-t követte Shiloh-ban.,
tovább, a szamaritánus Krónika Adler, vagy New Chronicle, úgy gondolják, hogy már áll a 18.században a korábbi krónikák forrásként, Államok:
és a gyermekek Izrael napjaiban három csoportra osztva. Az egyik a pogányok útálatosságai szerint cselekedett, és más isteneket szolgált; egy másik követte Eli-t, a Jafni fiát, bár sokan elfordultak tőle, miután felfedte szándékait; egy harmadik pedig Uzzi ben Bukki Főpapnál, a választott helyen maradt.,
a 2 király és Josephus hagyományos zsidó elbeszélése szerint Izrael népét az asszírok királya (Sargon II) eltávolította Halahba, Gozanba a Khabur folyón és a Medes városaiba. Az asszírok királya pedig megmondatott nékünk, és elhozá a népeket Babilonból, Kuthából, Avából, Emáthból és Sefarvaimból, hogy Szamáriába telepedjenek. Mivel Isten oroszlánokat küldött közöttük, hogy megöljék őket, az asszírok királya elküldte az egyik papot a Bételből, hogy tanítsa az új telepeseket Isten szertartásairól., Az esetleges eredmény az volt, hogy az új telepesek mind a föld Istenét, mind a saját isteneiket imádták azon országokból, ahonnan jöttek.
a Modern genetikai vizsgálatok (2004) arra utalnak, hogy a Szamaritánusok’ vonalak segítségével vezethető vissza, hogy egy közös őse, a Zsidók a paternally-örökölt Zsidó főpapság (Cohanim) időben a közeli időszakban az Asszír hódítás a királyság, Izrael, pedig valószínűleg leszármazottai a történelmi Izraelita lakosság, bár elszigetelt adott az emberek visszahúzódó történelem., Ez kétségbe vonja, ha nem teljesen cáfolja, ezt a történelmi elméletet, amelyet a szamaritánusok Asszíriából származtak.
továbbá a Holt-tengeri tekercs 4q372, amely elmondja azt a reményt, hogy az északi törzsek visszatérnek József földjére, megjegyzi, hogy az északi jelenlegi lakosok bolondok, ellenséges emberek, de nem kifejezetten külföldieknek nevezik őket. Ez azt jelenti, hogy ezek az emberek, a szamaritánusok, kigúnyolták Jeruzsálemet, és templomot építettek egy magas helyre (Gerizim), hogy provokálják Izraelt.,
a szamaritánusok és a zsidók közötti konfliktusok az asszír diaszpóra vége és a Bar Kokhba-lázadás között sokasodtak. A zsidó történetírás a szamaritánus lakosság többszöri felbujtását írja le a zsidók ellen és becsmérli őket, és Jézus irgalmas Szamaritánusról szóló példázata is bizonyítja a konfliktusokat. A Gerizim-hegy szamaritánus templomának megsemmisítését John Hyrcanus főpapnak tulajdonítják.
a sikertelen lázadások után a Gerizim-hegyet új templommal újították fel, amelyet végül ismét elpusztítottak a szamaritánus lázadások során., A szamaritánusok üldözése gyakori volt a következő évszázadokban.