Synonyymit: DNA-riippuvainen RNA-polymeraasi ,RNAP
englanti: RNA-polymeraasi DNA-riippuvainen RNA-polymeraasi
1 Määrittely
RNA-polymerases, ovat entsyymejä, joilla on tärkeä tehtävä geenien ilmentymisen vaihe transkriptio. Ne katalysoivat DNA-matriisin juosteen RNA-kopion tuotantoa käyttäen substraatteja ATP, GTP, UTP ja CTP.
ei saa sekoittaa: RNA-riippuvainen RNA-Polymeraasi
2 tyypit
2.,1 Prokaryootit
Prokaryootit on yksi RNA-polymeraasi, joka tuottaa kaikki koodaus (mRNA) ja ei-koodausta (esim. rRNA) RNA selostukset. Keskeinen entsyymi, RNA-polymeraasi on molekyylimassa on noin 400 kDa ja koostuu viidestä alayksiköstä:
keskeinen entsyymi, yhdessä sigma tekijä, muodostaa holoenzyme, että erityisesti tunnistaa ja sitoutuu promoottori järjestyksessä; sigma-tekijä, kuten RNA-polymeraasi, oppaita DNA oikea transkriptio alkaa.
2.,2 Eukaryooteissa
Eukariooteissa on neljä eri polymeraaseja, jotka eroavat toisistaan niiden lokalisointi-ja RNA voidaan syntetisoida:
- RNA-polymeraasi I: Syntetisoi pre-ribosomaalisen RNA: n (45) solun tumassa, joka on myöhemmin lisätty 5.,8S, 18S ja 28S rRNA-alayksikön Kypsyy
- RNA-Polymeraasi II transkriptio hnRNA (mRNA: n esiaste), snRNA ja snoRNA
- RNA-Polymeraasi III on mukana Siirto RNA (tRNA) ja 5S rRNA tarjoaa alayksikön ydin sitten
- mitokondrioiden RNA: n Polymeraasin: on Lokalisoitu mitokondrioita ja syntetisoitu mitokondrioiden RNA (mtRNA)
3 transkriptio prosessi
transkriptio prosessi on yleensä jaettu kolmeen vaiheeseen:
- Aloittaminen
- Venymä ja
- Irtisanominen.,
seuraavat prosessit mRNA transkriptio eukaryooteissa on kuvattu, kuten vuorovaikutus-polymeraasi ja transkriptiotekijät näkyy parhaiten.
3.1 Aloittamista
toisin Kuin DNA-polymerases, RNA-polymerases, eivät vaadi RNA primer. Tietty DNA-sekvenssi, ns promoottori, palvelee RNA-polymeraasi merkkiaineena lähtökohta., Se vaatii lukuisia transkriptio tekijät, kuten ylimääräisiä proteiineja, Yleiset transkriptiotekijät sitoutuvat pohjapinta promoottori elementtejä, sekä erityinen transkriptio tekijät sitoutuvat proksimaalinen ja distaalinen promoottori elementtejä.
Ennen RNA-synteesi, oikea lähtökohta geeni voidaan ilmaista, on havaittu. Tätä tarkoitusta varten, eri pohjapinta promoottori elementit ovat läsnä DNA, mukaan lukien TFIIB Tunnustamisen Elementti (BRE), on TATA-box-ja Loppupään promoottori elementtejä (DP-elementtejä)., Nämä pohjapinta promoottori elementtejä lähellä lähtökohtana ei tarvitse olla läsnä promoottori alueittain, eikä kaikille aloittamista alueilla on vielä ollut purettu.
Kun sitova yleinen transkriptio tekijä, TFIID promoottori alueen edelleen yleiset transkriptiotekijät (mukaan lukien TFIIB, TFIIA, TFIIH, TFIIE) ja RNA-polymeraasi II kertyä ja muodostavat yhdessä pre-initiation complex (PIC). TFIIHILLÄ on helikaasifunktio ja se purkaa DNA: n kaksoiskierteen ATP: n hydrolyysin alla., Näin muodostuu avoin aloituskompleksi, jossa RNA: n varsinainen synteesi voidaan katalysoida.
3.2 Venymä
Aikana venymä, RNA-polymeraasi syntetisoi nukleiinihapon säikeen 5′ 3′, eli lukemisen suuntaan matriisi strand (negatiivinen strand) on 3′ 5′. Vastakkaista juostetta eli geenin koodausjuostetta (plus strand,) ei lueta. Se on kuitenkin identtinen vastamuodostuneen RNA-juosteen kanssa, kun taas negatiivinen juoste täydentää sitä. Kuten kaikki RNA-molekyylit, myös uusi RNA-juoste sisältää tymiinin sijaan urasiilia.
3.,3 Terminaatio
päättymissignaali antaa todennäköisesti palindromisen DNA-sekvenssin, niin sanotun terminaattorin. Eukaryoottisten organismien tarkasta lopettamisprosessista tiedetään kuitenkin vain vähän.
4 RNA-synteesin mekanismi
RNA-synteesin synteesimekanismi on samanlainen kuin DNA-synteesissä. Se on nukleofiiliset hyökkäys happea atom 3′-OH ryhmän lopussa RNA strand α-fosfori atom uuden nukleosidi-trifosfaatti talletetaan kanssa toimituksen pyrofosfaatin (PPi)., Muodostuu fosforihappoesterisidos.
5. Asetus
eukaryooteissa, useita erityisiä proteiineja kutsutaan transkriptio tekijät ovat tarpeen säädellä transkription. Ne sitoutuvat erityisesti proksimaalisiin promoottorielementteihin, mikä aktivoi transkription. Distaaliset promoottorit aiheuttavat yleensä transkription tehostajan eli äänenvaimentimen., Tätä kuvataan yksityiskohtaisesti artikkelissa Geeniasetus.
6 virhetaso
RNA-polymeraasi on vähemmän tarkka kuin DNA-polymeraasi. Se tuottaa yli 104 kertaa enemmän virheitä. RNA: n lyhyen puoliintumisajan vuoksi suuri virhetaajuus on kuitenkin vähemmän välillinen. RNA-Polymaraasin luontainen eksonukleaasiaktiivisuus voi lisäksi irtautua virheellisestä nukleotidista uudelleen.