Maailmanlaajuinen Yhdenmukaistaminen
Global linjaus työkaluja luoda end-to-end-linjaus sekvenssit olla linjassa.
Neula (KORKOKUVA)
EMBOSS Neula luo optimaalisen maailmanlaajuinen yhdenmukaistaminen kaksi sekvenssit käyttäen Needleman-Wunsch-algoritmi.
Launch Neula
Paarit (KORKOKUVA)
EMBOSS Paarit käyttää muuttaminen Needleman-Wunsch-algoritmi, jonka avulla suurempia sekvenssejä olla maailmanlaajuisesti yhdenmukaistettu.,
Launch Paarit
Paikallinen Linjaus
Paikallinen linjaus työkaluja löytää yksi tai enemmän, linjaukset, joissa kuvataan eniten samanlainen alue(s) sisällä sekvenssit olla linjassa. Ne voivat yhdenmukaistaa proteiini-ja nukleotidisekvenssejä.
Vesi (KORKOKUVA)
EMBOSS Vettä käytetään Smith-Waterman-algoritmi (muunnettu nopeus parannuksia) laskea paikallinen linjaus kaksi sekvenssit.
Launch Vettä,
Matcher (KORKOKUVA)
EMBOSS Matcher tunnistaa paikallisia yhtäläisyyksiä kaksi sekvenssit käyttäen tiukka algoritmi perustuu LALIGN sovellus.,
Launch Haussa
LALIGN
LALIGN löytää sisäisiä päällekkäisyyksiä laskemalla ei-kanssa päällekkäiset paikallisia rinnastuksia proteiinia tai DNA-sekvenssit.
Launch LALIGN