alineación Global
las herramientas de alineación global crean una alineación de extremo a extremo de las secuencias a alinear.
Needle (EMBOSS)
EMBOSS Needle crea una alineación global óptima de dos secuencias utilizando el algoritmo Needleman-Wunsch.
Launch Needle
Stretcher (EMBOSS)
EMBOSS Stretcher utiliza una modificación del algoritmo Needleman-Wunsch que permite que las secuencias más grandes se alineen globalmente.,
Launch Stretcher
Local Alignment
Las herramientas de alineación Local encuentran una o más alineaciones que describen las regiones más similares dentro de las secuencias a alinear. Son capaces de alinear las secuencias de proteínas y nucleótidos.
Water (EMBOSS)
EMBOSS Water utiliza el algoritmo Smith-Waterman (modificado para mejoras de velocidad) para calcular la alineación local de dos secuencias.
Launch Water
Matcher (EMBOSS)
EMBOSS Matcher identifica similitudes locales entre dos secuencias utilizando un algoritmo riguroso basado en la aplicación LALIGN.,
Launch Matcher
LALIGN
lalign encuentra duplicaciones internas calculando alineaciones locales no intersectantes de secuencias de proteínas o ADN.
lanzar LALIGN