Globale Ausrichtung
Globale Ausrichtungswerkzeuge erstellen eine End-to-End-Ausrichtung der auszurichtenden Sequenzen.
Nadel (RELIEF)
RELIEF Nadel erzeugt eine optimale globale Ausrichtung von zwei Sequenzen mit dem Needleman-Wunsch Algorithmus.
Launch Needle
Stretcher (RELIEF)
RELIEF Stretcher verwendet eine Modifikation des Needleman-Wunsch-Algorithmus, mit der größere Sequenzen global ausgerichtet werden können.,
Launch Stretcher
Lokale Ausrichtung
Lokale Ausrichtungstools Finden Sie eine oder mehrere Ausrichtungen, die die ähnlichsten Regionen innerhalb der auszurichtenden Sequenzen beschreiben. Sie können Protein-und Nukleotidsequenzen ausrichten.
Wasser (PRÄGUNG)
PRÄGUNG Wasser verwendet den Smith-Waterman-Algorithmus (modifiziert für Geschwindigkeitsverbesserungen), um die lokale Ausrichtung von zwei Sequenzen zu berechnen.
Launch Water
Matcher (EMBOSS)
EMBOSS Matcher identifiziert lokale Ähnlichkeiten zwischen zwei Sequenzen mithilfe eines strengen Algorithmus, der auf der LALIGN-Anwendung basiert.,
Launch Matcher
LALIGN
LALIGN findet interne Duplikationen, indem es nicht überschneidende lokale Ausrichtungen von Protein-oder DNA-Sequenzen berechnet.
LALIGN starten