virus MERS-CoV er medlem af beta-gruppen af coronavirus, Betacoronavirus, slægt C. MERS-CoV genomer er fylogenetisk inddeles i to klader, clade A og B. De tidligste tilfælde af MERS var af clade En klynger (EMC/2012 og Jordan-N3/2012), og nye sager, der er genetisk forskellige (clade B).
MERS-CoV er en af syv kendte coronavirus til at inficere mennesker, includingHCoV-229E,HCoV-NL63,HCoV-OC43,HCoV-HKU1, den originalSARS-CoV (eller SARS-CoV-1), og SARS-CoV-2., MERS-CoV er adskilt fra SARS coronavirus, og adskiller sig fra den fælles-kolde coronavirus og kendt endemiske menneskelige betacoronaviruses HCoV-OC43 og HCoV-HKU1. Indtil 23. maj 2013 var MERS – CoV ofte blevet omtalt som en SARS-lignende virus, eller blot den nye coronavirus, og tidligere blev den omtalt på messageboards som den “saudiske SARS”.fra November 2019 er der rapporteret 2,494 tilfælde af MERS med 858 dødsfald, så dødeligheden er >30%. 182 genomer er blevet sekventeret af 2015 (94 Fra Mennesker og 88 Fra dromedære kameler)., Alle sekvenser er >99% ens. Genomerne kan opdeles i to clades – A og B – med de fleste tilfælde forårsaget af clade B. menneskelige og kamelstammer blandes, hvilket antyder flere transmissionsbegivenheder.
OriginEdit
den første bekræftede sag blev rapporteret i Jeddah, Saudi-Arabien i April 2012. Den egyptiske virolog Ali Mohamed .aki isolerede og identificerede en tidligere ukendt coronavirus fra mandens lunger. Zaki derefter sendt sine resultater på 24 September 2012 på ProMED-mail., De isolerede celler viste cytopatiske virkninger (CPE) i form af afrunding og dannelse af syncytia.
et andet tilfælde blev fundet i September 2012, en 49-årig mand, der boede i .atar, præsenterede lignende influen .asymptomer, og en sekvens af virussen var næsten identisk med den i det første tilfælde. I November 2012 optrådte lignende sager iatatar og Saudi-Arabien. Yderligere tilfælde blev bemærket med dødsfald forbundet, og hurtig forskning og overvågning af denne nye coronavirus begyndte.,Det er ikke sikkert, om infektionerne er resultatet af en enkelt .oonotisk begivenhed med efterfølgende overførsel fra menneske til menneske, eller hvis de flere geografiske infektionssteder repræsenterer flere infectionoonotiske begivenheder fra en ukendt fælles kilde.en undersøgelse foretaget af Riiad Memish fra Riyadh University og kolleger antyder, at virussen opstod engang mellem juli 2007 og juni 2012, med måske så mange som 7 separate .oonotiske transmissioner., Blandt dyrereservoirer, CoV har en stor genetisk mangfoldighed, men prøverne fra patienter antydede et lignende genom, og derfor almindelig kilde, skønt dataene var begrænsede. Det blev bestemt gennem molekylær uranalyse, at vira fra EMC/2012 og England/.atar/2012 dateres til begyndelsen af 2011, hvilket antyder, at disse tilfælde stammede fra en enkelt .oonotisk begivenhed. Det så ud til, at MERS-CoV havde cirkuleret i den menneskelige befolkning i mere end et år uden detektion og foreslået uafhængig transmission fra en ukendt kilde.,
TropismEdit
MERS-CoV: struktur, arrest, indgang, og genomisk sammensætning
I mennesker, den virus, der har en stærk tropisme for nonciliated bronkial epitelceller, og det har vist sig effektivt at unddrage sig de medfødte immunrespons og antagonisere interferon (IFN) produktionen i disse celler. Denne tropisme er unik, fordi de fleste respiratoriske vira er målrettet mod cilierede celler.,
på Grund af den kliniske lighed mellem MERS-CoV-og SARS-CoV det blev foreslået, at de kan bruge de samme cellulære receptor; den exopeptidase, angiotensin konverterende enzym 2 (ACE2). Det blev imidlertid senere opdaget, at neutralisering af ACE2 med rekombinante antistoffer ikke forhindrer MERS-CoV-infektion. Yderligere forskning identificerede dipeptidylpeptidase 4 (dpp4; også kendt som CD26) som en funktionel cellulær receptor for MERS-CoV. I modsætning til andre kendte coronavirus-receptorer er den en .ymatiske aktivitet af dpp4 ikke nødvendig for infektion., Som forventet er aminosyresekvensen af DPP4 stærkt bevaret på tværs af arter og udtrykkes i det humane bronchiale epitel og nyrer. Bat DPP4 gener synes at have været udsat for en høj grad af adaptiv evolution som en reaktion på coronavirus infektioner, så den slægt, der fører til MERS-CoV kan have cirkuleret i bat befolkninger i en lang periode af tid, før den overføres til mennesker.
TransmissionEdit
den 13.februar 2013 udtalte Verdenssundhedsorganisationen, at “risikoen for vedvarende person-til-person-transmission ser ud til at være meget lav.,”Cellerne MERS – CoV inficerer i lungerne tegner sig kun for 20% af respiratoriske epitelceller, så et stort antal virioner er sandsynligvis nødvendige for at blive indåndet for at forårsage infektion.
Dr. Anthony S. Fauci fra National Institutes of Health i Bethesda, Maryland, udtalte, at MERS-CoV “fra nu af ikke spredes på en vedvarende person til person måde overhovedet.”Dr. Fauci erklærede, at der er potentiel fare, fordi det er muligt for virussen at mutere til en stamme, der overfører fra person til person.,
infektionen af sundhedsarbejdere (HC.) har imidlertid ført til bekymring for overførsel fra menneske til menneske.Centers for Disease Control and Prevention (CDC) viser mere som overførbare fra menneske til menneske. Fra deres FA?, som svar på spørgsmålet “spredes MERS-CoV fra person til person?”, svarer de ” MERS-CoV har vist sig at sprede sig mellem mennesker, der er i tæt kontakt. Overførsel fra inficerede patienter til sundhedspersonale er også observeret. Klynger af sager i flere lande undersøges.,”Der er også en ne.York Times-artikel, der giver en vis korrelativ kontekst til dette.den 28. maj afslørede CDC imidlertid, at Illinois-manden, der oprindeligt blev antaget at have været den første forekomst af person til person-spredning (fra Indiana-manden på et forretningsmøde), faktisk havde testet negativt for MERS-CoV. Efter at have afsluttet yderligere og mere endelige tests ved hjælp af et neutraliserende antistofassay, har eksperter ved CDC konkluderet, at Indiana-patienten ikke spredte virussen til Illinois-patienten., Test konkluderede, at Illinois-manden ikke tidligere var blevet inficeret. Det er muligt for tavse MERS at forekomme, det er når patienten ikke udvikler symptomer. Tidlig forskning har vist, at op til 20% af tilfældene ikke viser tegn på aktiv infektion, men har MERS-CoV-antistoffer i deres blod.
EvolutionEdit
3D-model af en MERS-CoV spike protein
virus ser ud til at være opstået i flagermus. Selve viruset er blevet isoleret fra en flagermus., Denne virus er tæt knyttet til Tylonycteris bat coronavirus HKU4 og Pipistrellus bat coronavirus HKU5. Serologiske beviser viser, at disse vira har inficeret kameler i mindst 20 år. Den seneste fælles stamfar til flere humane stammer er dateret til marts 2012 (95% konfidensinterval December 2011 til juni 2012).
de foreliggende beviser tyder på, at virusserne har været til stede i flagermus i nogen tid og havde spredt sig til kameler i midten af 1990 ‘erne. virusserne ser ud til at have spredt sig fra kameler til mennesker i de tidlige 2010’ er., Den oprindelige flagermusværtsart og tidspunktet for den første infektion hos denne art er endnu ikke bestemt.
undersøgelse af sekvenserne af 238 isolater antydede, at denne virus har udviklet sig til tre clades, der er forskellige i kodonbrug, vært og geografisk distribution.
Natural reservoirEdit
tidlig forskning antydede, at virussen er relateret til en, der findes i den egyptiske grav flagermus. I September 2012 spekulerede Ron Fouchier på, at virussen måske har sin oprindelse i flagermus., Arbejde af epidemiolog Ian Lipkin fra Columbia University i Ne.York viste, at virussen isoleret fra en flagermus så ud til at være en kamp med den virus, der findes hos mennesker. 2c betacoronavirus blev påvist i nycteris-flagermus i Ghana og Pipistrellus-flagermus i Europa, der er fylogenetisk relateret til MERS-CoV-virussen., Men de store naturlige reservoir, hvor mennesker får virus infektion været ukendt indtil den 9 August 2013 en rapport i tidsskriftet the Lancet Infectious Diseases viser, at 50 ud af 50 (100%) blod serum fra Oman kameler og 15 af 105 (14%) fra spansk kameler havde protein-specifikke antistoffer mod MERS-CoV spike protein. Blodserum fra europæiske får, geder, kvæg og andre kamelider havde ingen sådanne antistoffer.
kort efter den 5.September 2013 offentliggjorde en seroepidemiologisk undersøgelse i journal of Eurosurveillance af R. A Perera et al., hvor de undersøgte 1343 menneskelige og 625 dyr sera er angivet, den rigelige forekomst af MERS-CoV specifikt antistof i 108 ud af 110 Egyptiske dromedar kameler, men ikke i andre dyr som geder, køer eller får i denne region. Dette er de første og betydningsfulde videnskabelige rapporter, der angav rollen som “dromedære kameler” som et reservoir af MERS-CoV.seneste arbejde forbinder kameler med virussen. En forsendelse forud for udskrivningen til tidsskriftet Emerging Infectious Diseases registrerer forskning, der viser coronavirus-infektionen i dromedære kamelkalve og voksne, 99.,9% matchende til genomerne af human clade B MERS-CoV.
mindst en person, der er blevet syg med MERS, var kendt for at være kommet i kontakt med kameler eller for nylig drak kamelmælk.lande som Saudi-Arabien og De Forenede Arabiske Emirater producerer og forbruger store mængder kamelkød. Muligheden findes, at afrikanske eller Australske flagermus har virussen og overfører den til kameler. Importerede kameler fra disse regioner kunne have båret virussen til Mellemøsten.,
i 2013 blev MERS-CoV identificeret i tre medlemmer af en dromedær kamel besætning holdt i en barnatar stald, som var knyttet til to bekræftede menneskelige sager, der siden er kommet sig. Tilstedeværelsen af MERS-CoV i Kamelerne blev bekræftet af National Institute of Public Health and Environment (RIVM) fra sundhedsministeriet og Erasmus Medical Center (Collabho Collaborating Center), Holland. Ingen af Kamelerne viste tegn på sygdom, da prøverne blev indsamlet., Qatar Øverste Råd for Sundhed rådes i November 2013, at mennesker med underliggende sundhedsmæssige betingelser, såsom hjertesygdomme, diabetes, nyre-sygdomme, åndedrætssygdomme, den immunsupprimerede, og de ældre, undgå tæt dyr kontakter, når du besøger gårde og markeder, og til at praktisere en god hygiejne, så som at vaske hænder.,
En yderligere undersøgelse på dromedar kameler fra Saudi-Arabien, som blev offentliggjort i December 2013 afsløret tilstedeværelsen af MERS-CoV i 90% af de evaluerede dromedar kameler (310), hvilket tyder på, at dromedar kameler ikke kun kan være den vigtigste reservoir af MERS-CoV, men også animalske kilde til MERS.
i henhold til MERS-CoV-sammendragsopdateringen 27.marts 2014 understøtter nylige undersøgelser, at kameler tjener som den primære kilde til, at MERS-CoV inficerer mennesker, mens flagermus kan være det ultimative reservoir for virussen., Bevis inkluderer den hyppighed, hvormed virussen er fundet i kameler, som humane tilfælde er blevet udsat for, seriologiske data, der viser udbredt transmission i kameler, og ligheden mellem kamel CoV og den menneskelige CoV.
Den 6. juni 2014, den Arabiske Nyheder avis fremhævet de nyeste forskningsresultater i New England Journal of Medicine, hvor en 44-årig Saudiarabisk mand, der holdt en besætning på ni kameler døde af MERS i November 2013., Hans venner sagde, at de var vidne til ham at anvende en aktuel medicin på næsen af en af hans syge kameler—fire af dem angiveligt syg med næseflåd—syv dage før han selv blev ramt af MERS. Forskere sekventerede virussen, der blev fundet i en af de syge kameler og virussen, der dræbte manden, og fandt, at deres genomer var identiske. I den samme artikel rapporterede de arabiske nyheder, at der fra 6. juni 2014 har været 689 tilfælde af MERS rapporteret inden for Kongeriget Saudi-Arabien med 283 dødsfald.,
TaxonomyEdit
MERS-CoV er mere tæt knyttet til bat coronavirus HKU4 og HKU5 (slægt 2C), end det er at SARS-CoV (slægt 2B) (2, 9), deling af mere end 90% sekvens identitet med deres nærmeste relationer, bat coronavirus HKU4 og HKU5 og derfor anses for at tilhøre den samme art af den Internationale Komité om Taksonomi af Virus (ICTV).,; positive-sense, enkelt-strenget RNA-virus” Kommando: Nidovirales” Family: Coronaviridae” Subfamily: Coronavirinae” Type: Betacoronavirus” Arter: Betacoronavirus 1 (almindeligvis kaldet Human coronavirus OC43), Menneskelige coronavirus HKU1, Murine coronavirus, Pipistrellus bat coronavirus HKU5, Rousettus bat coronavirus HKU9, Svær akut respiratorisk syndrom-relaterede coronavirus, Tylonycteris bat coronavirus HKU4, KONKURRENCEDYGTIGE-CoV
- Virus værter:
- Homo sapiens (mennesket)
- Kameler
- Flagermus
– Stammer:
- Isolere:
- Isolere:
- NCBI