I. G. Farben producerer giftig gas under Anden Verdenskrig. For eksempel, det fremstiller krigsførelse tabun og sarin gennem et driftsselskab, Anorgana GmbH med hovedsæde i Ludwigshafen, på Dyhernfurth fabrik nær Breslau, Polen. Det producerer også warfarearfare agent sennep gas på Gendorf beliggende i Bayern.
Zyklon B er en giftig gas fra hydrogen cyanid, der er anvendt i gaskamre i Nazisternes koncentrationslejre fra 1941 til systematisk mord langt mere end en million ofre, de fleste af dem Jøder., Oprindeligt udviklet som et pesticid, Zyklon B er solgt af Deutsche Gesellschaft für Schädlingsbekämpfung mbH (Degesch) blev grundlagt i 1919, og dets salgsselskaber tage over salget af Zyklon B fra 1930/1931. Efter krigens begyndelse (1939) bliver Weehrmacht og SS store kunder hos Degesch og dets salgsselskaber – ikke kun soldaters kaserner, men også kaserne i koncentrationslejre skal gennemgå desinfektion for at undgå spredning af sygdomsbærende skadedyr.
fra 1930 opretholder I. G. Farben en andel på 42, 5 procent i Degesch., Carl Wurster (1900-1974; 1952-1965 formand for Bestyrelsen Administrerende Direktører, af re-etableret BASF) bliver medlem af Degesch tilsvarende af en bestyrelse (Verwaltungsausschuss) i 1940. Efter krigen (1945) og især under Nürnberg-processen, rejses spørgsmålet om, hvorvidt repræsentanter for I. G. Farben vidste, at Zyklon B blev brugt til massemord på folk fra September 1941. Der er endnu ikke fundet et endeligt svar.,
under alle omstændigheder giver de stadig bevarede optegnelser og vidneberetninger ingen indikation af, at Carl .urster vidste om misbrug af pesticider til industriel masseudryddelse. Han og de øvrige medlemmer af Degesch bestyrelse, der ikke havde nogen indsigt i den daglige ledelse af virksomheden, ikke erkender, at eventuelle uregelmæssigheder i salgstal for Zyklon B. Dette skyldes, som krigen skred frem, mere og flere mennesker blev anbragt i lejre, så var det forventes, at efterspørgslen ville stige i pediculicides og andre særlige pesticider., Desuden er, det faktiske salg af Zyklon B var ikke signifikant højere efter massemordene i Auschwitz begynder i September 1941, end de var før. Wurster frifindes for alle anklager i 1948.
Desuden, ny forskning, konkluderer, at selv efter deltagelse af andre virksomheder (1930), Degesch ” en integreret del af Degussa virksomheden og ikke I. G. Farben, som det blev fejlagtigt antaget i retssager mod bestyrelsen for krigsforbrydelser, og mellem 1947 og 1948, og er stadig en udbredt opfattelse i dag.”