Global justering
værktøjer til justering af globale sekvenser skaber en justering fra ende til ende af de sekvenser, der skal justeres.
nål (prægning)
prægning nål skaber en optimal global tilpasning af to sekvenser ved hjælp af Needleman-.unsch algoritme.
Launch Needle
Stretcher (EMBOSS)
EMBOSS Stretcher bruger en ændring af Needleman-.unsch-algoritmen, der gør det muligt at tilpasse større sekvenser globalt.,
Launch Stretcher
lokal justering
lokale justeringsværktøjer find en eller flere justeringer, der beskriver de mest lignende regioner inden for de sekvenser, der skal justeres. De er kan justere protein og nukleotidsekvenser.
vand (prægning)
prægning af vand bruger Smith-Wateraterman-algoritmen (modificeret til hastighedsforbedringer) til at beregne den lokale justering af to sekvenser.
start vand
Matcher (EMBOSS)
EMBOSS Matcher identificerer lokale ligheder mellem to sekvenser ved hjælp af en streng algoritme baseret på LALIGN-applikationen., lalign LALIGN finder interne duplikationer ved at beregne ikke-krydsende lokale justeringer af protein-eller DNA-sekvenser.
start LALIGN