virus MERS-CoV je členem skupiny beta koronavirus, Betacoronavirus, lineage. C. MERS-CoV genomy jsou fylogeneticky rozděleny do dvou skupin, clade a a B. prvních případů MERS byly clade A klastrů (EMC/2012 a Jordánsko-N3/2012), a nové případy jsou geneticky odlišné (clade B).
MERS-CoV je jedním ze sedmi známých coronaviry infikovat lidi, includingHCoV-229E,HCoV-NL63,HCoV-OC43,HCoV-HKU1, originalSARS-CoV (nebo SARS-CoV-1), a SARS-CoV-2., MERS-CoV je odlišný od koronaviru SARS a odlišný od běžného chladného koronaviru a známých endemických lidských betakoronavirů HCoV-OC43 a HCoV-HKU1. Až do 23. Května 2013, MERS-CoV byly často odkazoval se na jako SARS-like virus, nebo jednoduše románu koronavirus, a dříve to bylo odkazoval se na hovorově na messageboards jako „Saudi SARS“.
v listopadu, 2019, 2,494 případy MERS byly hlášeny s 858 úmrtí, takže v případě úmrtí je >30%. Do roku 2015 bylo sekvenováno 182 genomů (94 od lidí a 88 od dromedárních velbloudů)., Všechny sekvence jsou > 99% podobné. Genomy mohou být rozděleny do dvou clades – a A B-s většinou případů jsou způsobeny clade B. lidské a velbloudí kmeny jsou smíchány naznačuje více přenosových událostí.
OriginEdit
první potvrzený případ byl hlášen v Džiddě v Saúdské Arábii v dubnu 2012. Egyptský virolog Ali Mohamed Zaki izoloval a identifikoval dříve neznámý koronavirus z plic člověka. Zaki pak zveřejnil svá zjištění dne 24. září 2012 na ProMED-mail., Izolované buňky vykazovaly cytopatické účinky (CPE) ve formě zaoblení a tvorby syncytie.
v září 2012 byl nalezen druhý případ, 49letý muž žijící v Kataru měl podobné příznaky chřipky a sekvence viru byla téměř totožná s sekvencí prvního případu. V listopadu 2012 se podobné případy objevily v Kataru a Saúdské Arábii. Byly zaznamenány další případy, se souvisejícími úmrtími, a začal rychlý výzkum a monitorování tohoto nového koronaviru.,Není jisté, zda jsou infekce výsledkem jediné zoonotické události s následným přenosem z člověka na člověka, nebo zda více geografických míst infekce představuje více zoonotických událostí z neznámého společného zdroje.
studie Ziad Memish Rijádu University a jeho kolegové naznačují, že virus vznikl někdy mezi červencem 2007 a v červnu 2012, s možná tolik jako 7 samostatných zoonotických přenosů., Mezi zvířecími nádržemi má CoV velkou genetickou rozmanitost, ale vzorky od pacientů navrhly podobný genom, a proto společný zdroj, i když data byla omezená. Bylo zjištěno pomocí analýzy molekulárních hodin, že viry z data EMC/2012 a Anglie/Katar/2012 do začátku roku 2011 naznačují, že tyto případy pocházely z jediné zoonotické události. Zdálo se, že MERS-CoV cirkuluje v lidské populaci déle než jeden rok bez detekce a navrhl nezávislý přenos z neznámého zdroje.,
TropismEdit
MERS-CoV: struktura, upevnění, vchod, a genomové složení
U lidí, virus má silnou tropismu pro nonciliated bronchiální epiteliální buňky, a to bylo prokázáno, že účinně vyhnout vrozené imunitní odpovědi a znepřátelit interferon (IFN) produkce v těchto buňkách. Tento tropismu je unikátní v tom, že většina respiračních virů cílová řasinkami buněk.,
Vzhledem k klinické podobnosti mezi MERS-CoV a SARS-CoV, bylo navrženo, že se mohou použít stejný buněčný receptor; exopeptidase, inhibitory angiotenzin konvertujícího enzymu 2 (ACE2). Později však bylo zjištěno, že neutralizace ACE2 rekombinantními protilátkami nezabrání infekci MERS-CoV. Další výzkum identifikoval dipeptidylpeptidázy 4 (DPP4; také známý jako CD26) jako funkční buněčný receptor pro MERS-CoV. Na rozdíl od jiných známých receptorů koronaviry není enzymatická aktivita DPP4 nutná pro infekci., Jak by se dalo očekávat, aminokyselinová sekvence DPP4 je vysoce konzervována napříč druhy a je vyjádřena v lidském bronchiálním epitelu a ledvinách. Bat DPP4 geny se zdají být zatíženy vysokou mírou adaptivní evoluce jako odpověď na koronavirus infekce, takže linie vedoucí k MERS-CoV může mít obíhal v netopýřích populací na dlouhou dobu předtím, než je přenáší na lidi.
TransmissionEdit
Světová zdravotnická organizace dne 13.února 2013 uvedla, že „riziko trvalého přenosu z člověka na člověka se zdá být velmi nízké.,“Buňky MERS-CoV infikují v plicích pouze 20% respiračních epiteliálních buněk, takže je pravděpodobné, že k inhalaci bude zapotřebí velké množství virionů, které způsobí infekci.
Dr. Anthony S. Fauci z National Institutes of Health v Bethesdě v Marylandu, uvádí, že od teď MERS-CoV „nešíří v trvalý člověka k člověku.“Dr. Fauci uvedl, že existuje potenciální nebezpečí v tom, že je možné, že virus zmutuje do kmene, který se přenášet z člověka na člověka.,
infekce zdravotnických pracovníků (HCW) však vedla k obavám z přenosu člověka na člověka.
Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) uvádějí MERS jako přenosné z člověka na člověka. Z jejich FAQ, v odpovědi na otázku “ šíří se MERS-CoV z člověka na člověka?“, odpovídají “ ukázalo se, že MERS-CoV se šíří mezi lidmi, kteří jsou v úzkém kontaktu. Byl také pozorován přenos z infikovaných pacientů na zdravotnický personál. Shluky případů v několika zemích jsou vyšetřovány.,“Existuje také článek New York Times, který k tomu poskytuje určitý korelační kontext.
Nicméně, na 28. Května, CDC ukázaly, že Illinois muž, který byl původně myslela, že byl první výskyt člověka na člověka šíří (z Indiana muž na obchodní jednání), byl ve skutečnosti negativní testy na MERS-CoV. Po dokončení další a další konečné testy pomocí neutralizujících protilátek, odborníci v CDC k závěru, že Indiana pacient neměl šířit virus na Illinois pacienta., Testy dospěly k závěru, že muž z Illinois nebyl dříve infikován. Je možné, že se vyskytnou tiché Mery, to je, když pacient nevyvíjí příznaky. Časný výzkum ukázal, že až 20% případů nevykazuje žádné známky aktivní infekce, ale má v krvi protilátky MERS-CoV.
EvolutionEdit
3D model MERS-CoV spike bílkovin
virus se zdá mít původ v netopýry. Samotný virus byl izolován z netopýra., Tento virus úzce souvisí s Tylonycteris bat coronavirus HKU4 a Pipistrellus bat coronavirus HKU5. Sérologické důkazy ukazují, že tyto viry infikovaly velbloudy po dobu nejméně 20 let. Poslední společný předek několika lidských kmenů byl datován do března 2012 (95% interval spolehlivosti prosinec 2011 až červen 2012).
dostupné důkazy k dnešnímu dni naznačuje, že viry byly přítomny v pálky na nějakou dobu a měl šířit velbloudi v polovině 1990. Viry, objeví se šíří z velbloudů na člověka v časném 2010s., Původní hostitelský druh netopýra a doba počáteční infekce u tohoto druhu ještě nebyly stanoveny.
zkoumání sekvencí 238 izolátů naznačuje, že se tento virus vyvinul do tří clades lišících se používáním kodonu, hostitelem a geografickou distribucí.
přírodní nádrž
raný výzkum naznačil, že virus souvisí s virem nalezeným v egyptské hrobce. V září 2012 Ron Fouchier spekuloval, že virus mohl vzniknout u netopýrů., Práce epidemiolog Ian Lipkin z Columbijské Univerzity v New Yorku prokázala, že virus izolovaný z bat vypadal zápas viru v člověka. 2C betakoronaviry byly zjištěny u netopýrů Nycteris v Ghaně a netopýrů Pipistrellus v Evropě, které jsou fylogeneticky příbuzné viru MERS-CoV., Nicméně hlavní přírodní nádrž, kde se lidé dostat virus infekce zůstala neznámá až do dne 9. srpna 2013 zprávu v časopise The Lancet Infekční Choroby ukázala, že 50 z 50 (100%), krevní sérum z Ománských velbloudů a 15 105 (14%) od španělské velbloudy měl protein-specifické protilátky proti MERS-CoV spike bílkovin. Krevní sérum z evropských ovcí, koz, skotu a jiných velbloudů nemělo takové protilátky.
Brzy poté, dne 5. září 2013 seroepidemiological studie zveřejněné v časopise Eurosurveillance R. O Perera et al., kde jsou zkoumány 1343 lidské a 625 zvířat sera uvedeno, hojné přítomnosti MERS-CoV specifických protilátek ve 108 ze 110 Egyptské dromedárů, ale ne v ostatní zvířata, jako jsou kozy, krávy nebo ovce v této oblasti. Jedná se o první a významné vědecké zprávy, které naznačovaly roli „dromedárních velbloudů“ jako nádrže MERS-CoV.
poslední práce spojuje velbloudy s virem. Na před-of-print odeslání pro časopis Emerging Infekčních Nemocí záznamy výzkum ukazuje, koronavirus infekce v dromedár velbloud telat a dospělých, 99.,9% odpovídá genomům lidského clade B MERS-CoV.
bylo známo, že alespoň jedna osoba, která onemocněla MERS, přišla do styku s velbloudy nebo nedávno pila velbloudí mléko.
země jako Saúdská Arábie a Spojené arabské emiráty produkují a konzumují velké množství velbloudího masa. Existuje možnost, že Afričtí nebo Australští netopýři virus ukrývají a přenášejí ho na velbloudy. Dovezené velbloudy z těchto oblastí mohly virus přenést na Blízký východ.,
V roce 2013 MERS-CoV byl identifikován ve třech členů dromedár velbloud stádo konat v Kataru stodoly, která byla vázána na dva potvrzené případy u lidí, kteří se od té doby zvýšily. Přítomnosti MERS-CoV v velbloudů bylo potvrzeno Národního Ústavu Veřejného Zdraví a Prostředí (RIVM) Ministerstva Zdravotnictví a Erasmus Medical Center (WHO Spolupracujících Center), Nizozemsko. Žádný z velbloudů nevykazoval žádné známky onemocnění, když byly vzorky odebrány., Katar Nejvyšší Rady pro Zdravotnictví doporučuje v listopadu 2013, že lidé s základní zdravotní podmínky, jako jsou srdeční choroby, diabetes, onemocnění ledvin, onemocnění dýchacích cest, oslabenou imunitou a starší osoby, vyhnout nějaké blízké zvíře kontakty při návštěvě farmy a trhy, a praxe dobré hygieny, jako je mytí rukou.,
další studium na dromedárů ze Saúdské Arábie publikoval v prosinci 2013 bylo zjištěno, přítomnosti MERS-CoV v 90% hodnoceného dromedárů (310), což naznačuje, že dromedárů nejen že by mohla být hlavním zdrojem MERS-CoV, ale také zvíře zdrojem MERS.
Podle dne 27. Března 2014 MERS-CoV shrnutí aktualizace, nedávné studie podporují, že velbloudi sloužit jako primární zdroj MERS-CoV, že nakažení lidé, zatímco netopýři mohou být hlavním zdrojem viru., Důkaz zahrnuje frekvenci, s jakou se virus byl nalezen v velbloudy, na které lidské případy byly vystaveny, seriological údaje, které ukazují, rozšířený přenos v velbloudy, a podobnost velblouda CoV pro lidské CoV.
Na 6. června 2014, Arabské noviny zdůraznily nejnovější výsledky výzkumu v New England Journal of Medicine, ve kterém 44-rok-starý Saúdská muž, který držel stádo devět velbloudů zemřel na MERS v listopadu 2013., Jeho přátelé řekl, že byl svědkem ho použití lokální přípravek do nosu jednoho z jeho nemocný velbloudi—čtyři z nich údajně nemocní s nosní výtok—sedm dní předtím, než se stal zasažených MERS. Vědci sekvenovali virus nalezený v jednom z nemocných velbloudů a viru, který zabil muže, a zjistili, že jejich genomy jsou totožné. Ve stejném článku arabské zprávy uvedly, že k 6.červnu 2014 bylo v Království Saúdské Arábie hlášeno 689 případů MERS s 283 úmrtími.,
TaxonomyEdit
MERS-CoV je více úzce souvisí s bat coronaviry HKU4 a HKU5 (lineage 2C), než je SARS-CoV (lineage 2B) (2, 9), sdílení více než 90% sekvenční identitu s jejich nejbližšími vztahy, bat coronaviry HKU4 a HKU5 a proto za to patří ke stejnému druhu Mezinárodní Výbor pro Taxonomii Virů (ICTV).,; pozitivní smysl, single-stranded RNA viry“ Příkaz: Nidovirales“ Rodina: Coronaviridae“ Podčeleď: Coronavirinae“ Typ: Betacoronavirus“ Druh: Betacoronavirus 1 (běžně se nazývá Lidský koronavirus OC43), Lidský koronavirus HKU1, Myší koronavirus, Pipistrellus bat koronavirus HKU5, Rousettus bat koronavirus HKU9, těžký akutní respirační syndrom-související koronavirus, Tylonycteris bat koronavirus HKU4, KONKURENČNÍ-CoV
- hostitelé Virus:
- Homo sapiens (human)
- Velbloudy
- Netopýry
Kmeny:
- Izolovat:
- Izolovat:
- NCBI