koloniální Charta Savannah zakázala římským katolíkům usadit se ve městě. Angličtí správci se obávali, že katolíci budou věrnější španělským úřadům na Floridě než anglické vládě v Gruzii, nicméně tento zákaz zmizel krátce po americké revoluci. Sbor Církve byl reorganizován kolem roku 1796. Francouzské Katolické emigrace založil první kostel v roce 1799 poté, co uprchl na Haiti po povstání otroků, které začalo na Karibský ostrov v roce 1791., Na počátku 19.století se stal hlavním kostelem svobodných černochů z Haiti. Stavba začala na nové katedrále svatého Jana Křtitele v roce 1859. Stavba byla téměř zničena požárem v roce 1898, ale usilovným úsilím byla přestavěna do roku 1899. Katedrála bazilika svatého Jana Křtitele byla první budova v Gruzii postavená z cihel. Je vybaven 81 vitráže, 16 chrliče, je 214 stop vysoký s výškou střechy 96 chodidla, převzal 90,000 měděné hřebíky a 45,000 břidlice postavit.,
sboru postavena jeho první kostel na Náměstí Svobody v roce 1779 a v roce 1811, vyberte si místo na Drayton a Perry Ulic pro větší budovy. Biskup John England diecéze Charleston, který zahrnoval Savannah, zasvětil nový kostel 1. Dubna 1839. Papež Pius IX založena Diecéze Savannah v červenci 1850 a sbor začal plánovat novou katedrálu na Náměstí Lafayette v roce 1870 pod Savannah čtvrtý Biskup, Ctihodný otec Ignatius Persico., Most Reverend James Roosevelt Bayley, arcibiskup Baltimore, předsedal věnování novogotické svatyně 30. Dubna 1876. Cihlové konstrukci však chyběly věže, které byly přidány až v roce 1896, kdy získala také povlak štuku a vápna.
6. února 1898 požár zametl budovu a zanechal pouze zdi a věže, avšak Kongregace se rychle přestavěla a v roce 1899 mohla oslavit vánoční mši v novém zařízení. Struktura však opět nebyla úplná a výzdoba interiéru trvala dalších 13 let., Vitráže byly instalovány kolem roku 1904. Farnosti se ujal následné opravování projektů v 1959-1965, která se zabývala vytápění, chlazení a osvětlení a dekorace; 1984-1985, posílit strukturální základy a realizovat změny, které navrhl Druhý Vatikánský koncil a 1998-2000 k instalaci nové střešní krytiny, a obnovit původní interiérové barvy a dekorace.
Papež František povýšil v roce 2020 stav kostela na baziliku minor.