alinhamento Global
ferramentas de alinhamento Global criam um alinhamento extremo-a-extremo das sequências a alinhar.
Needleman (EMBOSS)
EMBOSS Needle cria um alinhamento global óptimo de duas sequências usando o algoritmo Needleman-Wunsch.
agulha de lançamento
Maca (EMBOSS)
Maca ainda usa uma modificação do algoritmo Needleman-Wunsch que permite que sequências maiores sejam alinhadas globalmente.,
Maca de lançamento
alinhamento Local
ferramentas de alinhamento Local encontrar um ou mais alinhamentos descrevendo a(s) Região (s) mais semelhante (s) dentro das sequências a serem alinhadas. São sequências de proteínas e nucleótidos.
água (EMBOSS)
EMBOSS água usa o algoritmo Smith-Waterman (modificado para melhorias de velocidade) para calcular o alinhamento local de duas sequências. Matcher (EMBOSS) identifica semelhanças locais entre duas sequências usando um algoritmo rigoroso baseado na aplicação LALIGN.,
Lançador Matcher
LALIGN
LALIGN encontra duplicações internas calculando alinhamentos locais não intersectados de sequências de proteínas ou ADN. lancem o LALIGN